More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1338 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 150 aa  309  6.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  42.25 
 
 		 536 aa  90.9  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1443  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  34.78 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0179  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0431401  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  30.37 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  30.43 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  36.03 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2080  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.397171  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  31.5 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 272 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  29.45 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 229 aa  64.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 182 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  29.71 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  31.78 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  28.26 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  27.54 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  31.17 
 
 		 248 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  30.99 
 
 		 205 aa  60.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  27.46 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  32.98 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  28.35 
 
 		 430 aa  58.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  29.45 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 		 302 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 282 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 216 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  29.58 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  30.87 
 
 		 270 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  30.87 
 
 		 270 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 		 206 aa  57  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  30.87 
 
 		 270 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  23.74 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  27.07 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  28.79 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  31.48 
 
 		 424 aa  54.3  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  25.76 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  27.87 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  28.26 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  27.48 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  24.63 
 
 		 229 aa  52  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1550  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.979768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  35.29 
 
 		 473 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  27.41 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1465  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 207 aa  51.2  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  27.52 
 
 		 310 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  28.91 
 
 		 322 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  34.48 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  26.52 
 
 		 317 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  27.91 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 208 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  36.56 
 
 		 208 aa  49.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  25.38 
 
 		 311 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  25.38 
 
 		 311 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3460  mutT/nudix family protein  29.29 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284792  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  25.38 
 
 		 311 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3732  mutT/nudix family protein  29.29 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0824  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.612559  hitchhiker  0.000224465 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3688  mutT/nudix family protein  29.29 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.237209 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 194 aa  48.9  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.38 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01990  ADP-ribose pyrophosphatase  38.96 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 		 184 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5143  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 		 282 aa  47.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3377  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  28.57 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  24.26 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0931  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.21 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.906348  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  27.87 
 
 		 186 aa  47.4  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>