221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2888 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2888  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 147 aa  300  6.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2869  NUDIX hydrolase  61.38 
 
 		 145 aa  180  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.855553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3486  NUDIX hydrolase  58.5 
 
 		 150 aa  178  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1208  NUDIX hydrolase  60.69 
 
 		 145 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00522859  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0494  NUDIX hydrolase  61.87 
 
 		 146 aa  171  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2646  NUDIX hydrolase  57.24 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0278305  normal  0.974409 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0072  NUDIX hydrolase  52.48 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3091  mutT/nudix family protein  31.09 
 
 		 155 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.030376  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3089  mutT/nudix family protein  32 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0777965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2779  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  31.09 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2190  mutT/nudix family protein  30.71 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000611721 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3072  mutT/nudix family protein  32 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0647  MutT/nudix family protein  27.35 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3056  mutT/nudix family protein  32 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2819  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  29.41 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2846  mutT/nudix family protein  29.41 
 
 		 155 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3060  mutT/nudix family protein  29.41 
 
 		 155 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.780249  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0487  MutT/nudix family protein  28.23 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.450276  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2537  NUDIX family hydrolase  29.13 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1169  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  34.29 
 
 		 305 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  50 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2666  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.271242  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07700  NTP pyrophosphohydrolase  30.32 
 
 		 241 aa  48.9  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.054443  normal  0.43952 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  46.77 
 
 		 282 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 299 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5172  NUDIX hydrolase  29.08 
 
 		 177 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 174 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 		 188 aa  47.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  24.46 
 
 		 179 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2723  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 		 178 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.346967  hitchhiker  0.000510454 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04903  hypothetical protein  30.6 
 
 		 172 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 		 253 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000745  MutT/nudix family protein  28.57 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 190 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0604  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0701215  normal  0.289612 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  27.91 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1553  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 		 176 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  23.57 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  27.05 
 
 		 179 aa  45.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  37.33 
 
 		 255 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4302  dinucleoside polyphosphate hydrolase  56.41 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 		 204 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  32.1 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 211 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 311 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0463  NUDIX hydrolase  25.74 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 311 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3133  NUDIX hydrolase  23.2 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0415  NUDIX hydrolase  47.73 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  35.29 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  35.29 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  35.29 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  35.29 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  35.29 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  35.29 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  33.75 
 
 		 170 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  23.57 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  35.29 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 180 aa  44.7  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  31.63 
 
 		 311 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  35.29 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  30.48 
 
 		 317 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 		 197 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  39.13 
 
 		 185 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  29.9 
 
 		 184 aa  44.3  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3272  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.14 
 
 		 176 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000105899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  40.35 
 
 		 176 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 		 179 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0171  ADP-ribose diphosphatase NudE  43.64 
 
 		 183 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4188  ADP-ribose diphosphatase NudE  43.64 
 
 		 183 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0167  ADP-ribose diphosphatase NudE  42.86 
 
 		 193 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 176 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3399  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.14 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2153  NUDIX family hydrolase  26.36 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  37.93 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1336  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.723792 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2021  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226256 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0958  MutT/nudix family protein  40 
 
 		 465 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  31 
 
 		 216 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4211  dinucleoside polyphosphate hydrolase  54.05 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.165705 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  24.81 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>