126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3486 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3486  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 150 aa  300  4.0000000000000003e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1208  NUDIX hydrolase  61.97 
 
 		 145 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00522859  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2888  NUDIX hydrolase  58.5 
 
 		 147 aa  178  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2869  NUDIX hydrolase  61.27 
 
 		 145 aa  174  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.855553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2646  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 145 aa  155  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0278305  normal  0.974409 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0494  NUDIX hydrolase  52.82 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0072  NUDIX hydrolase  49.65 
 
 		 147 aa  133  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0647  MutT/nudix family protein  31.06 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3091  mutT/nudix family protein  26.79 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.030376  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2779  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  27.68 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3072  mutT/nudix family protein  27.68 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2846  mutT/nudix family protein  26.79 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2819  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  26.79 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3060  mutT/nudix family protein  26.79 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.780249  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  40.45 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  50.75 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2723  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.346967  hitchhiker  0.000510454 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2190  mutT/nudix family protein  25.45 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000611721 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2537  NUDIX family hydrolase  30.09 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3133  NUDIX hydrolase  26.05 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3089  mutT/nudix family protein  25.89 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0777965  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 		 281 aa  48.9  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0487  MutT/nudix family protein  27.97 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.450276  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 188 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5172  NUDIX hydrolase  27.45 
 
 		 177 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3056  mutT/nudix family protein  26.13 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2666  NUDIX hydrolase  26.03 
 
 		 175 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.271242  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 211 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  31.72 
 
 		 317 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2718  mutT/nudix family protein  27.06 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2669  MutT/Nudix family protein  27.06 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2926  mutT/nudix family protein  27.06 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  28.57 
 
 		 171 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  44.07 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3873  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.666215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2021  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226256 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2925  mutT/nudix family protein  27.06 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.38475e-24 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  28.57 
 
 		 171 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  44.74 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 174 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 188 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  47.76 
 
 		 299 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2490  MutT/Nudix family protein  36.07 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0847665  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 209 aa  42.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3272  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.1 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000105899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  30.85 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  31.76 
 
 		 255 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0463  NUDIX hydrolase  26.36 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  38.98 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0906  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  51.28 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3651  mutT/nudix family protein  32.14 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2763  mutT/nudix family protein  36.07 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000181576 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2789  mutT/nudix family protein  36.07 
 
 		 145 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000364509  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3557  mutT/nudix family protein  29.09 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239001  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 		 172 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0760  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 		 182 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2153  NUDIX family hydrolase  25 
 
 		 173 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  30.68 
 
 		 253 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3831  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 361 aa  41.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 		 173 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 147 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  32.99 
 
 		 169 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  36.07 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2646  MutT/Nudix family protein  30.88 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.785802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  36.07 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0981  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.1 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.12815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 315 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3241  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.1 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000341046  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1033  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.1 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236129  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3232  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.1 
 
 		 176 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000155637  hitchhiker  0.0000853193 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3217  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.1 
 
 		 176 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000360016  hitchhiker  0.00252549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3168  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.1 
 
 		 176 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000367916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3151  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.1 
 
 		 176 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000021359  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3331  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.1 
 
 		 176 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000146788  hitchhiker  0.005493 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1666  mutT/nudix family protein  29.82 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.00436e-21 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02678  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.1 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000336855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0861  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117938  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0203  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.71 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0958  MutT/nudix family protein  40 
 
 		 465 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2976  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.1 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.85852e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3150  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.1 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000288941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0885  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.1 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000193658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000745  MutT/nudix family protein  30.89 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3032  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.1 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.33004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4096  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.1 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580084  hitchhiker  0.00923204 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>