More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3942 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  100 
 
 
167 aa  337  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2763  mutT/nudix family protein  38.97 
 
 
145 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000181576 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  38.64 
 
 
145 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2490  MutT/Nudix family protein  38.24 
 
 
145 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0847665  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2525  MutT/Nudix family protein  38.24 
 
 
145 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000393058  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  37.12 
 
 
145 aa  100  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  37.12 
 
 
145 aa  100  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2789  mutT/nudix family protein  37.12 
 
 
145 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000364509  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  41.8 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  41.32 
 
 
157 aa  92.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  40.5 
 
 
162 aa  90.9  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2105  mutT/nudix family protein  38.4 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2286  mutT/nudix family protein  38.4 
 
 
149 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02194e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  38.4 
 
 
149 aa  90.1  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  34.4 
 
 
153 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  34.4 
 
 
153 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 
153 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  35.2 
 
 
229 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  38.4 
 
 
149 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
143 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  33.6 
 
 
153 aa  89  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  33.6 
 
 
153 aa  89  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  33.6 
 
 
153 aa  89  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  33.6 
 
 
153 aa  89  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  33.6 
 
 
153 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  34.4 
 
 
153 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 
153 aa  87.8  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
160 aa  87.8  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  36.29 
 
 
156 aa  87.8  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2371  mutT/nudix family protein  36.8 
 
 
149 aa  87.4  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0511564  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2042  MutT/Nudix family protein  37.6 
 
 
149 aa  87.4  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1178  NUDIX hydrolase  33.76 
 
 
156 aa  87.4  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0049447  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1249  NUDIX hydrolase  33.75 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000159356 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3063  NUDIX hydrolase  45.37 
 
 
165 aa  85.5  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  33.11 
 
 
149 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 
157 aa  85.1  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  32.61 
 
 
159 aa  85.1  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0219  NUDIX hydrolase  38.28 
 
 
158 aa  85.1  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203556  normal  0.450694 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  34.36 
 
 
161 aa  84.7  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  32.61 
 
 
159 aa  84  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 
160 aa  83.6  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  37.21 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5571  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0243609  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0682  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
156 aa  82  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0132833  normal  0.0334373 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  39.83 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2595  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
148 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 
156 aa  79  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  28.87 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  29.37 
 
 
154 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  38.26 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3076  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  29.86 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3370  MutT/nudix family protein  30.71 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.312506  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3137  mutT/nudix family protein  31.15 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0554874  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  27.97 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3045  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  30.33 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3372  mutT/nudix family protein  30.33 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1505  MutT/nudix family protein  42.55 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000663569  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3352  phosphohydrolase  29.92 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  28.87 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3374  MutT/nudix family protein  31.15 
 
 
149 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00196022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  28.67 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1730  ADP-ribose pyrophosphatase  32.62 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2802  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.44267  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  31.01 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0215  ADP-ribose pyrophosphatase  36.21 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0696282  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  31.01 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  31.01 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  27.97 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  31.01 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  32.85 
 
 
158 aa  72  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  31.01 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  28.17 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15360  ADP-ribose pyrophosphatase  37.58 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  29.08 
 
 
154 aa  72  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  30.95 
 
 
149 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  30.95 
 
 
149 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  30.47 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4380  mutT/nudix family protein  30.47 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000407544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1879  mutT/nudix family protein  30.33 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003180  MutT/nudix family protein  45.36 
 
 
96 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2524  MutT/nudix family protein  38.14 
 
 
99 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.921198  hitchhiker  0.00375744 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  29.58 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  41.58 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>