More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0883 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  100 
 
 
164 aa  336  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  74.53 
 
 
171 aa  266  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  67.28 
 
 
164 aa  233  7e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  66.25 
 
 
170 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  60.74 
 
 
171 aa  225  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  65.84 
 
 
177 aa  225  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  60.87 
 
 
184 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 
178 aa  117  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0860  NUDIX hydrolase  42.54 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0809  hypothetical protein  39.46 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0825  NUDIX hydrolase  38.78 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.184951 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
187 aa  80.9  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
187 aa  80.9  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0755  NUDIX hydrolase  38.78 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0327905 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1133  putative phosphatase  38.57 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0118269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0930  NUDIX hydrolase  38.56 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  38.56 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1412  NUDIX hydrolase  38.56 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533482  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1292  NUDIX hydrolase  36.6 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.387319  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2820  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202234  normal  0.119996 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1423  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 
198 aa  77.4  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1331  NUDIX hydrolase  36.6 
 
 
178 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.051474  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1315  putative phosphatase  38.62 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174362  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1027  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 
192 aa  74.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0810  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 
198 aa  74.3  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1666  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.57 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0714  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.57 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.429601  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0903  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.57 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.332961  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1432  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.57 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0447  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.57 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1643  NUDIX family hydrolase  38.57 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3725  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  32.89 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1821  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.57 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2657  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.14 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  43.43 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  29.87 
 
 
201 aa  70.5  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  36.46 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  35.79 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3171  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  29.33 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  35.79 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  34.97 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  28.19 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.97 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.97 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.97 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  34.97 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.97 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  34.97 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
198 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  34.97 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  29.56 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  37 
 
 
265 aa  67.8  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  27.7 
 
 
190 aa  67.8  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  36.79 
 
 
181 aa  67.8  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  29.45 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3170  NUDIX hydrolase  44.16 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
198 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 
183 aa  67  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
212 aa  64.3  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  27.52 
 
 
182 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  38.83 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 
187 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2130  NUDIX hydrolase  39.8 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
200 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1601  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 
195 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0469554  normal  0.381093 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  27.52 
 
 
195 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 
195 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  28.86 
 
 
182 aa  62.4  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  41.57 
 
 
185 aa  62.4  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  28.86 
 
 
182 aa  62.4  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  35.56 
 
 
187 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
182 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  30 
 
 
229 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 
212 aa  61.6  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>