More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1133 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1133  putative phosphatase  100 
 
 		 180 aa  368  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118269 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3725  NUDIX hydrolase  62.57 
 
 		 177 aa  248  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  67.43 
 
 		 204 aa  243  6.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3171  NUDIX hydrolase  64.2 
 
 		 177 aa  240  9e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  65.29 
 
 		 187 aa  238  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  64.71 
 
 		 187 aa  234  7e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  61.76 
 
 		 200 aa  233  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  65.29 
 
 		 192 aa  231  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1027  NUDIX hydrolase  63.53 
 
 		 189 aa  227  6e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2820  NUDIX hydrolase  59.3 
 
 		 176 aa  203  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202234  normal  0.119996 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1292  NUDIX hydrolase  55.23 
 
 		 178 aa  201  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.387319  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1331  NUDIX hydrolase  55.23 
 
 		 178 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.051474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0930  NUDIX hydrolase  54.07 
 
 		 178 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1412  NUDIX hydrolase  54.07 
 
 		 178 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533482  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  54.07 
 
 		 178 aa  197  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  55.81 
 
 		 178 aa  197  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  53.49 
 
 		 178 aa  197  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1315  putative phosphatase  57.8 
 
 		 176 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1821  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  55.06 
 
 		 209 aa  193  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0447  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  55.06 
 
 		 209 aa  193  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0714  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  55.06 
 
 		 209 aa  193  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.429601  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0903  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  55.06 
 
 		 183 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.332961  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1643  NUDIX family hydrolase  55.06 
 
 		 183 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1666  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  55.06 
 
 		 183 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1432  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  55.06 
 
 		 183 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2657  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  52.81 
 
 		 184 aa  191  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0860  NUDIX hydrolase  55.21 
 
 		 194 aa  182  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0825  NUDIX hydrolase  52.84 
 
 		 193 aa  176  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.184951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0755  NUDIX hydrolase  52.84 
 
 		 193 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0327905 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0809  hypothetical protein  52.27 
 
 		 193 aa  175  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0810  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 171 aa  87.8  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  35.57 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  39.55 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  29.25 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3700  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 301 aa  72  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.663184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  37.59 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  33.56 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  32.88 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  30.14 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  28.08 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  32.88 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2482  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000632611  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0187  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.805777 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  32.65 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3410  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.564798  normal  0.674483 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 341 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  27.42 
 
 		 280 aa  61.2  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  29.66 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  28.89 
 
 		 272 aa  60.8  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  30.14 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  30.46 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  28.65 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  33.61 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02952  NADH pyrophosphatase  29.14 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0865  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 319 aa  58.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  30.67 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.34 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.34 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  30.34 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  30.34 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.34 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  30.34 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.34 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  30.34 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  28.48 
 
 		 293 aa  57.8  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0205  NUDIX hydrolase  29.45 
 
 		 305 aa  57.8  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 298 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  32.26 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0170  NUDIX hydrolase  29.09 
 
 		 327 aa  57  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>