More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1643 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1643  NUDIX family hydrolase  100 
 
 
183 aa  370  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0447  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  100 
 
 
209 aa  370  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0903  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  100 
 
 
183 aa  370  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.332961  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1432  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  100 
 
 
183 aa  370  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1821  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  100 
 
 
209 aa  370  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0714  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  100 
 
 
209 aa  370  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.429601  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1666  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  100 
 
 
183 aa  370  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2657  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  92.78 
 
 
184 aa  345  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  83.05 
 
 
178 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  82.49 
 
 
178 aa  305  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0930  NUDIX hydrolase  82.49 
 
 
178 aa  305  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  81.92 
 
 
178 aa  305  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1412  NUDIX hydrolase  82.49 
 
 
178 aa  305  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533482  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1331  NUDIX hydrolase  83.62 
 
 
178 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.051474  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1292  NUDIX hydrolase  83.62 
 
 
178 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.387319  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2820  NUDIX hydrolase  79.31 
 
 
176 aa  286  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202234  normal  0.119996 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1315  putative phosphatase  77.59 
 
 
176 aa  283  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174362  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0755  NUDIX hydrolase  65.5 
 
 
193 aa  234  6e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0327905 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0825  NUDIX hydrolase  65.5 
 
 
193 aa  232  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.184951 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0809  hypothetical protein  64.25 
 
 
193 aa  231  6e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0860  NUDIX hydrolase  62.35 
 
 
194 aa  222  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0810  NUDIX hydrolase  57.65 
 
 
198 aa  211  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  63.86 
 
 
187 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  63.86 
 
 
187 aa  211  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  57.71 
 
 
204 aa  209  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3725  NUDIX hydrolase  56.73 
 
 
177 aa  208  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3171  NUDIX hydrolase  57.89 
 
 
177 aa  207  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  56.73 
 
 
200 aa  203  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1027  NUDIX hydrolase  61.45 
 
 
189 aa  202  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  59.64 
 
 
192 aa  200  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1133  putative phosphatase  55.06 
 
 
180 aa  192  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0118269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
187 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  37.33 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  41.43 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
187 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  35.84 
 
 
171 aa  78.2  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  37.84 
 
 
177 aa  70.9  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3971  NUDIX hydrolase  30.29 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  31.03 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  28.75 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
286 aa  68.6  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 
317 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  39.55 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  38 
 
 
323 aa  68.2  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  30.71 
 
 
289 aa  67  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0170  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  35.48 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4689  NUDIX hydrolase  35 
 
 
297 aa  65.5  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276951  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  32.89 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15070  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  31.08 
 
 
329 aa  65.1  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  29.17 
 
 
283 aa  64.7  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 
288 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  31.08 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 
182 aa  64.3  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 
181 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  29.1 
 
 
298 aa  63.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
183 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
187 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 
314 aa  63.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 
261 aa  63.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
163 aa  63.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  31.58 
 
 
303 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0254  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 
319 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
265 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0187  NUDIX hydrolase  33.97 
 
 
331 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.805777 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0522  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 
317 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0294847  normal  0.653584 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13222  NADH pyrophosphatase  39.47 
 
 
313 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.861891 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 
298 aa  62.8  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
185 aa  62.4  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
341 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  29.1 
 
 
282 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 
183 aa  62  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4236  NAD(+) diphosphatase  35.14 
 
 
321 aa  62.4  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0400368  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27580  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  33.61 
 
 
331 aa  62  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
196 aa  62  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 
212 aa  62  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  26.38 
 
 
280 aa  62  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 
318 aa  62  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3700  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 
301 aa  62  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.663184  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  29.24 
 
 
183 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  31.29 
 
 
181 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  29.75 
 
 
269 aa  61.6  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  30.61 
 
 
184 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  27.94 
 
 
260 aa  60.8  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>