More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1027 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1027  NUDIX hydrolase  100 
 
 
189 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  81.08 
 
 
187 aa  319  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  80.54 
 
 
187 aa  316  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  75.96 
 
 
192 aa  296  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  71.76 
 
 
204 aa  258  5.0000000000000005e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  68.54 
 
 
200 aa  258  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3725  NUDIX hydrolase  64.97 
 
 
177 aa  254  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3171  NUDIX hydrolase  65.71 
 
 
177 aa  248  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1133  putative phosphatase  63.53 
 
 
180 aa  227  6e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0118269 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1432  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  61.45 
 
 
183 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0903  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  61.45 
 
 
183 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.332961  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1666  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  61.45 
 
 
183 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1643  NUDIX family hydrolase  61.45 
 
 
183 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0714  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  61.21 
 
 
209 aa  201  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.429601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1821  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  61.96 
 
 
209 aa  201  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0447  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  61.21 
 
 
209 aa  201  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0860  NUDIX hydrolase  52.2 
 
 
194 aa  198  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1292  NUDIX hydrolase  61.96 
 
 
178 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.387319  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1331  NUDIX hydrolase  61.96 
 
 
178 aa  197  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.051474  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  58.93 
 
 
178 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2657  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  59.04 
 
 
184 aa  194  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0809  hypothetical protein  56.02 
 
 
193 aa  192  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0930  NUDIX hydrolase  59.51 
 
 
178 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1412  NUDIX hydrolase  59.51 
 
 
178 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533482  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0825  NUDIX hydrolase  54.82 
 
 
193 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.184951 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  58.9 
 
 
178 aa  191  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  58.28 
 
 
178 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0755  NUDIX hydrolase  54.22 
 
 
193 aa  190  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0327905 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2820  NUDIX hydrolase  58.9 
 
 
176 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202234  normal  0.119996 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1315  putative phosphatase  58.9 
 
 
176 aa  185  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174362  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0810  NUDIX hydrolase  49.2 
 
 
198 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 
184 aa  86.3  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  36.43 
 
 
170 aa  79  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 
183 aa  79  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  40.77 
 
 
164 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  35.29 
 
 
307 aa  77  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  32.17 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
298 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  32 
 
 
288 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  31.47 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 
325 aa  67.8  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  31.03 
 
 
282 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 
187 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  34.53 
 
 
183 aa  67  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0240  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930023  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  28.17 
 
 
283 aa  65.5  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  30 
 
 
278 aa  65.5  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0254  NUDIX hydrolase  26.75 
 
 
319 aa  65.5  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 
318 aa  65.5  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 
286 aa  65.1  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
382 aa  65.1  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  38.32 
 
 
265 aa  65.1  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  33.9 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
183 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.69 
 
 
181 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  29.58 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
198 aa  64.3  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.69 
 
 
181 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  30.99 
 
 
187 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13222  NADH pyrophosphatase  35.11 
 
 
313 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.861891 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  31.69 
 
 
181 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.69 
 
 
181 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.69 
 
 
181 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 
198 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  31.69 
 
 
181 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  31.69 
 
 
181 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  31.69 
 
 
181 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  25.49 
 
 
314 aa  63.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  34.71 
 
 
177 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 
181 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 
181 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 
181 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 
198 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 
181 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 
181 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>