298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0240 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0240  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 183 aa  374  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930023  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  57.89 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  52.15 
 
 		 212 aa  172  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  53.74 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  55.86 
 
 		 181 aa  168  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  55.48 
 
 		 177 aa  167  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  53.79 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  57.34 
 
 		 183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 		 194 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  53.79 
 
 		 181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  55.86 
 
 		 186 aa  165  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  52.11 
 
 		 198 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  52.82 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  52.11 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  52.11 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  52.11 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  52.11 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  52.11 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  52.11 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  52.11 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  52.82 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  52.11 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  49.07 
 
 		 179 aa  159  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  52.11 
 
 		 195 aa  158  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  51.41 
 
 		 181 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  51.41 
 
 		 181 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  51.41 
 
 		 181 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  51.41 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  52.03 
 
 		 182 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1601  NUDIX hydrolase  52.11 
 
 		 195 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0469554  normal  0.381093 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1077  NUDIX hydrolase  51.35 
 
 		 173 aa  154  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.167553 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  51.41 
 
 		 195 aa  154  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2482  NUDIX hydrolase  51.06 
 
 		 182 aa  150  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000632611  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  49.01 
 
 		 185 aa  150  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  54.74 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3410  NUDIX hydrolase  51.82 
 
 		 184 aa  148  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.564798  normal  0.674483 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  51.06 
 
 		 182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  51.06 
 
 		 182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  49.33 
 
 		 181 aa  144  6e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  51.77 
 
 		 185 aa  144  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  48.18 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  52.48 
 
 		 183 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  51.77 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  50.35 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  47.22 
 
 		 185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  50.36 
 
 		 183 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  44.3 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  46.48 
 
 		 181 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  47.89 
 
 		 182 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  43.29 
 
 		 187 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  43.29 
 
 		 187 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  43.29 
 
 		 187 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  46.9 
 
 		 187 aa  134  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0721  NUDIX hydrolase  47.79 
 
 		 157 aa  134  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.267739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  42.07 
 
 		 187 aa  134  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  48.91 
 
 		 183 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 		 181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  47.14 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  42.07 
 
 		 187 aa  131  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  42.14 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15850  hypothetical protein  49.64 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0332954 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  45.52 
 
 		 196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  43.54 
 
 		 201 aa  128  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  42.76 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  43.75 
 
 		 187 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 187 aa  125  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  45.14 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0013  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.466543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  27.46 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  28.32 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1027  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  33.6 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 		 204 aa  64.3  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 265 aa  64.3  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3171  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  30 
 
 		 144 aa  60.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0810  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  28.38 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  28.67 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2657  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.23 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3725  NUDIX hydrolase  26.96 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0809  hypothetical protein  32.63 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  36.9 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0447  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.09 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1821  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.09 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0714  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.09 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.429601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>