293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1077 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1077  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 173 aa  361  2e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.167553 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  87.27 
 
 		 186 aa  301  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  66.67 
 
 		 195 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1601  NUDIX hydrolase  65.06 
 
 		 195 aa  237  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0469554  normal  0.381093 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  66.27 
 
 		 198 aa  236  8e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  66.27 
 
 		 181 aa  236  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  66.27 
 
 		 181 aa  234  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  66.27 
 
 		 181 aa  235  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  66.27 
 
 		 181 aa  235  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  66.27 
 
 		 181 aa  235  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  66.27 
 
 		 181 aa  235  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  66.27 
 
 		 181 aa  235  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  66.27 
 
 		 181 aa  235  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  66.27 
 
 		 181 aa  235  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  66.27 
 
 		 181 aa  234  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  66.27 
 
 		 181 aa  235  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  66.27 
 
 		 181 aa  234  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  64.24 
 
 		 195 aa  232  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  64.46 
 
 		 181 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  63.86 
 
 		 181 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  64.46 
 
 		 198 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  63.86 
 
 		 181 aa  231  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  61.82 
 
 		 194 aa  228  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  61.82 
 
 		 194 aa  227  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  63.25 
 
 		 181 aa  226  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  58.43 
 
 		 182 aa  201  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  58.43 
 
 		 182 aa  201  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3410  NUDIX hydrolase  56.79 
 
 		 184 aa  195  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.564798  normal  0.674483 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  54.82 
 
 		 183 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  55.42 
 
 		 181 aa  193  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  54.49 
 
 		 182 aa  192  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2482  NUDIX hydrolase  57.76 
 
 		 182 aa  192  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000632611  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 		 182 aa  191  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  56.17 
 
 		 183 aa  190  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  53.61 
 
 		 177 aa  190  9e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  53.61 
 
 		 181 aa  189  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  53.94 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  54.94 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  54.49 
 
 		 187 aa  187  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  52.66 
 
 		 201 aa  185  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  54.12 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  54.32 
 
 		 183 aa  185  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  51.2 
 
 		 181 aa  184  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  54.32 
 
 		 183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  56.17 
 
 		 183 aa  181  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  51.5 
 
 		 183 aa  180  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  51.19 
 
 		 198 aa  180  9.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  54.32 
 
 		 183 aa  180  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  53.37 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  51.81 
 
 		 179 aa  177  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  54.32 
 
 		 183 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  49.09 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15850  hypothetical protein  55.15 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0332954 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  47.56 
 
 		 187 aa  161  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0721  NUDIX hydrolase  53.85 
 
 		 157 aa  158  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.267739 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0240  NUDIX hydrolase  51.35 
 
 		 183 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930023  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  46.3 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  46.91 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  48.59 
 
 		 212 aa  148  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  46.36 
 
 		 182 aa  135  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  39.63 
 
 		 187 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  40.61 
 
 		 187 aa  131  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  39.63 
 
 		 187 aa  131  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  39.63 
 
 		 187 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 		 187 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 		 187 aa  121  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 187 aa  121  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  38.18 
 
 		 187 aa  121  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 190 aa  85.9  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0013  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.466543  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  30.38 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  30.11 
 
 		 184 aa  62  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 178 aa  62  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  33.05 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3171  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1027  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3725  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  31.96 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  39.09 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  30.82 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  31.96 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  31.96 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0320  NUDIX hydrolase  46.27 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  31.47 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2139  NUDIX hydrolase  25.61 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1666  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.78 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1432  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.78 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1412  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533482  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>