More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0750 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  100 
 
 
212 aa  427  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  61.54 
 
 
156 aa  172  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  57.93 
 
 
153 aa  169  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  54.86 
 
 
154 aa  159  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  54.23 
 
 
166 aa  158  5e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0842  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 
176 aa  153  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0134181 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  50.35 
 
 
150 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  50.35 
 
 
150 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  56.62 
 
 
140 aa  141  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  54.69 
 
 
140 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  55.47 
 
 
140 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  48.57 
 
 
150 aa  132  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  48.59 
 
 
150 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  55.28 
 
 
130 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  48.12 
 
 
144 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  52.31 
 
 
146 aa  125  6e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  49.64 
 
 
150 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  45.52 
 
 
148 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  47.59 
 
 
236 aa  123  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  44.36 
 
 
148 aa  121  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  44.97 
 
 
157 aa  121  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  48.48 
 
 
149 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  48.87 
 
 
142 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  42.95 
 
 
154 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  47.9 
 
 
137 aa  112  5e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  46.92 
 
 
143 aa  111  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1187  NUDIX hydrolase  44.29 
 
 
143 aa  108  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  45.24 
 
 
144 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  48 
 
 
139 aa  102  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  41.04 
 
 
171 aa  101  9e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  45.19 
 
 
151 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0529  NUDIX hydrolase  49.59 
 
 
150 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 
137 aa  99.4  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  46.72 
 
 
156 aa  97.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
171 aa  97.1  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 
171 aa  96.7  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  39.84 
 
 
137 aa  95.1  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
135 aa  90.5  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  47.58 
 
 
132 aa  89.4  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
240 aa  88.2  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  36.65 
 
 
229 aa  85.1  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  32.89 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  39.61 
 
 
251 aa  78.6  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32661  predicted protein  32.62 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540856  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  36.6 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 
248 aa  75.1  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 
252 aa  74.7  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 
164 aa  74.3  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  38.41 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 
219 aa  72  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 
239 aa  71.6  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  30.06 
 
 
178 aa  67.8  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  32.74 
 
 
229 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  28.4 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  27.95 
 
 
177 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  30.15 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
273 aa  65.1  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  37.4 
 
 
184 aa  64.3  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  38.05 
 
 
232 aa  64.7  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  46.38 
 
 
158 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 
151 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
164 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  40.17 
 
 
226 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 
171 aa  63.5  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.88 
 
 
362 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 
153 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 
190 aa  62.8  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
155 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
155 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6285  cytidyltransferase-related domain protein  34.69 
 
 
358 aa  62.8  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000881728  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
155 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
155 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  29.82 
 
 
153 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  29.82 
 
 
153 aa  62.4  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  29.82 
 
 
153 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  29.82 
 
 
153 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  29.82 
 
 
153 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  29.82 
 
 
153 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
155 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
155 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  29.82 
 
 
153 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 
233 aa  62  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  29.61 
 
 
225 aa  62  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.33 
 
 
345 aa  62  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  28.57 
 
 
154 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>