205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1805 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  100 
 
 
253 aa  507  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  45.31 
 
 
255 aa  159  4e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2885  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 
175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755007  normal  0.649673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  42.76 
 
 
167 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1103  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
169 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
156 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 
169 aa  87  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3492  NUDIX hydrolase  38.78 
 
 
157 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  43.97 
 
 
230 aa  87  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0064  putative ATP/GTP-binding protein  40 
 
 
157 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  37.31 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 
218 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6876  putative ATP/GTP-binding protein  42.05 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0189  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 
161 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
282 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29780  ADP-ribose pyrophosphatase  33.09 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1141  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 
165 aa  59.7  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 
146 aa  55.8  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 
134 aa  53.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5041  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 
148 aa  52  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  28.57 
 
 
160 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
157 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4226  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 
162 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 
156 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  53.57 
 
 
291 aa  50.4  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  42.03 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  50.82 
 
 
124 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  52.27 
 
 
155 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  33.58 
 
 
347 aa  48.9  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3754  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 
132 aa  48.9  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
155 aa  48.9  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3429  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 
129 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 
152 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  45.45 
 
 
149 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 
164 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
171 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 
299 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 
134 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  40 
 
 
137 aa  47.4  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  30.16 
 
 
132 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
132 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
157 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
158 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2719  mutT/nudix family protein  41.67 
 
 
147 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00471958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2498  mutT/nudix family protein  41.67 
 
 
147 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2683  mutT/nudix family protein  41.67 
 
 
147 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2888  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 
147 aa  47  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
142 aa  47  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0058  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 
183 aa  47.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.993982  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2698  mutT/nudix family protein  41.67 
 
 
147 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000763334 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  47.27 
 
 
132 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 
167 aa  46.2  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
144 aa  46.6  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  47.27 
 
 
132 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  42.19 
 
 
160 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  42.19 
 
 
160 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  33 
 
 
305 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
149 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2749  mutT/nudix family protein  41.67 
 
 
147 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  45.24 
 
 
139 aa  45.8  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4804  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
188 aa  45.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.483514 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  49.02 
 
 
147 aa  45.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  50 
 
 
162 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  36.11 
 
 
159 aa  45.8  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  36.11 
 
 
159 aa  45.8  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 
153 aa  45.8  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2672  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 
158 aa  45.8  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0408434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0219  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 
158 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203556  normal  0.450694 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  27.73 
 
 
140 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.98 
 
 
133 aa  45.8  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  46.94 
 
 
156 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  31.93 
 
 
322 aa  45.8  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 
132 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0682  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
156 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0132833  normal  0.0334373 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  35.94 
 
 
313 aa  45.8  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2429  MutT/Nudix family protein  41.67 
 
 
147 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
166 aa  45.4  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
525 aa  45.4  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 
128 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
142 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 
137 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  33.82 
 
 
316 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  44.64 
 
 
153 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2459  MutT/Nudix family protein  41.67 
 
 
147 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000023854  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  30.4 
 
 
164 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  29.46 
 
 
155 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
175 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  38.57 
 
 
141 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  48 
 
 
135 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  41.07 
 
 
136 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
153 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  41.86 
 
 
172 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
143 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
142 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  44.64 
 
 
153 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  44.23 
 
 
134 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  35.29 
 
 
315 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 
153 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  47.17 
 
 
164 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
140 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>