More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0189 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0189  NUDIX hydrolase  100 
 
 
161 aa  322  9e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6876  putative ATP/GTP-binding protein  41.33 
 
 
175 aa  110  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29780  ADP-ribose pyrophosphatase  42.52 
 
 
163 aa  100  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  44.37 
 
 
167 aa  99  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1103  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 
169 aa  93.2  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
169 aa  88.2  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 
282 aa  87.4  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  40.29 
 
 
156 aa  85.5  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3492  NUDIX hydrolase  41.25 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0064  putative ATP/GTP-binding protein  40 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  44.44 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  36.64 
 
 
253 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  41.94 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1141  NUDIX hydrolase  41.09 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2885  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755007  normal  0.649673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 
230 aa  72  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 
134 aa  61.2  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  38.53 
 
 
149 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3536  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
168 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0178  mutT/nudix family protein  32.48 
 
 
168 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4746  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 
168 aa  57.4  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  38.95 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2037  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5063  mutT/nudix family protein  31.62 
 
 
168 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 
135 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  32.74 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5064  mutT/nudix family protein  30.77 
 
 
168 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 
154 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 
145 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  30.25 
 
 
160 aa  54.7  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 
134 aa  54.7  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1689  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 
145 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  32.74 
 
 
153 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  32.74 
 
 
164 aa  54.7  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  32.74 
 
 
164 aa  54.7  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  30.37 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 
153 aa  54.7  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4795  mutT/nudix family protein  30.77 
 
 
168 aa  54.3  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.223434  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4636  Nudix hydrolase  30.77 
 
 
168 aa  54.3  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  32.74 
 
 
164 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5158  mutT/nudix family protein  30.77 
 
 
168 aa  54.3  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.972651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5035  mutT/nudix family protein  30.77 
 
 
168 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  31.11 
 
 
153 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4656  Nudix hydrolase  30.77 
 
 
168 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
137 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  40.26 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3378  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0616  mutT/nudix family protein  32.74 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4760  mutT/nudix family protein  31.85 
 
 
153 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000960716  hitchhiker  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 
137 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
132 aa  52  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  36.17 
 
 
135 aa  51.6  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
137 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  45.33 
 
 
346 aa  51.6  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  45.33 
 
 
345 aa  51.6  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  32.23 
 
 
143 aa  51.6  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 
156 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 
142 aa  51.2  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 
135 aa  51.2  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 
171 aa  51.2  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3074  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 
155 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  44.59 
 
 
167 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2213  NUDIX hydrolase  36 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121469  normal  0.536334 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3006  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 
141 aa  50.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
175 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  26.57 
 
 
179 aa  49.7  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  40.32 
 
 
129 aa  48.9  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3653  mutT/nudix family protein  42.03 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 
133 aa  48.9  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  40.32 
 
 
129 aa  48.9  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
298 aa  48.5  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
143 aa  48.5  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  33.06 
 
 
136 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13920  ADP-ribose pyrophosphatase  33.57 
 
 
220 aa  47.8  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.625001  normal  0.785558 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  48 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  44 
 
 
345 aa  47.8  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  30.4 
 
 
314 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  31.86 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
156 aa  47.8  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  26.36 
 
 
170 aa  47.8  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  33.6 
 
 
316 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
144 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  47.92 
 
 
346 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 
155 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0912  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 
146 aa  47.4  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  35.92 
 
 
212 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  47.92 
 
 
346 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 
155 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 
155 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  27.41 
 
 
139 aa  47  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  28.3 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>