More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2278 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 134 aa  278  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  70.15 
 
 		 134 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  68.15 
 
 		 135 aa  187  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  65.52 
 
 		 145 aa  183  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  65.52 
 
 		 145 aa  183  6e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  62.25 
 
 		 151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3378  NUDIX hydrolase  64.83 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  68.15 
 
 		 135 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  61.04 
 
 		 154 aa  181  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  67.41 
 
 		 135 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0017  MutT/nudix family protein  67.91 
 
 		 133 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  66.67 
 
 		 135 aa  179  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  66.42 
 
 		 133 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0465  NUDIX hydrolase  59.85 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0415  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3701  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.899383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4760  mutT/nudix family protein  34.31 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000960716  hitchhiker  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  30.43 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 		 170 aa  57  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  30.43 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0616  mutT/nudix family protein  34.31 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189637  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  45.83 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  30.7 
 
 		 530 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  31.2 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  34.31 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  29.71 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  34.31 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2525  MutT/Nudix family protein  29.41 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000393058  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  34.31 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  34.31 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2763  mutT/nudix family protein  29.41 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000181576 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  34.31 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  34.04 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  34.31 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07700  NTP pyrophosphohydrolase  43.33 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.054443  normal  0.43952 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3241  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.36 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000341046  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0981  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.36 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.12815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1033  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.36 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236129  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2789  mutT/nudix family protein  28.7 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000364509  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 		 155 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3824  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.23 
 
 		 175 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000167151  normal  0.427646 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2490  MutT/Nudix family protein  26.89 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0847665  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  35.96 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0292  hypothetical protein  31.76 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0394428 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 		 155 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0189  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  31.58 
 
 		 162 aa  52  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  27.5 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  28.99 
 
 		 181 aa  52.4  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29780  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 		 155 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  33.64 
 
 		 167 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 		 155 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13920  ADP-ribose pyrophosphatase  30.33 
 
 		 220 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.625001  normal  0.785558 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3017  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.09 
 
 		 175 aa  51.6  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000442704  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 		 155 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  29.73 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0904  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.95 
 
 		 177 aa  50.8  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000367518  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 		 179 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3198  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.09 
 
 		 175 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084868  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3272  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.95 
 
 		 176 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000105899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3352  phosphohydrolase  33.05 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  30.51 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  33.65 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3076  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3399  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.95 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1735  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45.31 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2431  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960036  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  43.08 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3536  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  36.71 
 
 		 255 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0861  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117938  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  45.31 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  29.06 
 
 		 229 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3370  MutT/nudix family protein  31.62 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.312506  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3232  dinucleoside polyphosphate hydrolase  31.82 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000155637  hitchhiker  0.0000853193 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2977  dinucleoside polyphosphate hydrolase  31.82 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801466  hitchhiker  0.0062852 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  43.75 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2976  dinucleoside polyphosphate hydrolase  31.82 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.85852e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  43.75 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3150  dinucleoside polyphosphate hydrolase  31.82 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000288941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>