More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1537 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  323  5e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  57.52 
 
 
169 aa  157  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2885  NUDIX hydrolase  45.52 
 
 
175 aa  106  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755007  normal  0.649673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  40.4 
 
 
156 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
230 aa  100  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  43.05 
 
 
218 aa  97.8  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0064  putative ATP/GTP-binding protein  41.43 
 
 
157 aa  87.4  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6876  putative ATP/GTP-binding protein  37.96 
 
 
175 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3492  NUDIX hydrolase  42.76 
 
 
157 aa  82  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29780  ADP-ribose pyrophosphatase  36.43 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  36.92 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0189  NUDIX hydrolase  50.67 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1103  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  34.53 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1141  NUDIX hydrolase  40.6 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0017  MutT/nudix family protein  31.62 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  34.06 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3378  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 
133 aa  62.4  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 
135 aa  62  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 
135 aa  62  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  44 
 
 
135 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
145 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  43.27 
 
 
158 aa  58.5  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
151 aa  57.8  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
124 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  49.02 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1593  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
155 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  45.71 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
155 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  29.17 
 
 
159 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
155 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
156 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  43.94 
 
 
159 aa  55.1  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  53.85 
 
 
175 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4746  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  40 
 
 
193 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0178  mutT/nudix family protein  31.3 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
153 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  34.48 
 
 
140 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 
305 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
171 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  37.33 
 
 
229 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  41.67 
 
 
140 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  41.67 
 
 
140 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  41.67 
 
 
140 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
134 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  41.67 
 
 
140 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  41.67 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  41.67 
 
 
140 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  35.59 
 
 
159 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
169 aa  52  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  30.83 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  41.67 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  30.17 
 
 
158 aa  51.6  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3536  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 
168 aa  51.6  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 
158 aa  51.6  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  29.69 
 
 
258 aa  51.2  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
171 aa  51.2  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 
154 aa  51.2  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  27.13 
 
 
153 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0536  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
140 aa  50.8  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2498  mutT/nudix family protein  26.52 
 
 
147 aa  50.8  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2683  mutT/nudix family protein  26.52 
 
 
147 aa  50.8  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 
136 aa  50.8  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  36.25 
 
 
151 aa  50.4  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  36.25 
 
 
151 aa  50.4  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  34.57 
 
 
153 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  35.59 
 
 
158 aa  50.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1300  NUDIX family hydrolase  31.71 
 
 
118 aa  50.4  0.000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.898276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5035  mutT/nudix family protein  30.43 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4795  mutT/nudix family protein  30.43 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.223434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  28.12 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4636  Nudix hydrolase  30.43 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4656  Nudix hydrolase  30.43 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5064  mutT/nudix family protein  30.43 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  53.19 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5158  mutT/nudix family protein  30.43 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.972651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 
153 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
132 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
169 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  34.57 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13920  ADP-ribose pyrophosphatase  44.16 
 
 
220 aa  49.7  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.625001  normal  0.785558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>