227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6512 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 167 aa  318  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  48.32 
 
 		 156 aa  130  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  49.68 
 
 		 169 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2885  NUDIX hydrolase  51.75 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755007  normal  0.649673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1103  NUDIX hydrolase  45.7 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  47.17 
 
 		 162 aa  119  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3492  NUDIX hydrolase  46.9 
 
 		 157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6876  putative ATP/GTP-binding protein  44.74 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  49.6 
 
 		 230 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0064  putative ATP/GTP-binding protein  45.93 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  42.58 
 
 		 282 aa  103  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  42.76 
 
 		 253 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  46.15 
 
 		 255 aa  98.6  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  42.75 
 
 		 218 aa  93.6  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0189  NUDIX hydrolase  44.37 
 
 		 161 aa  90.9  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29780  ADP-ribose pyrophosphatase  37.16 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1141  NUDIX hydrolase  45.19 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  59.18 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  44 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  45.71 
 
 		 155 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 		 156 aa  51.2  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  34.39 
 
 		 187 aa  50.8  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  36.71 
 
 		 530 aa  50.8  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  32.5 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  33.83 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15990  hypothetical protein  41.38 
 
 		 160 aa  50.1  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4226  NUDIX hydrolase  44.16 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2672  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0408434 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 		 199 aa  48.5  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 		 142 aa  48.9  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 		 156 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 		 156 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6325  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  46.15 
 
 		 149 aa  47.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  46.15 
 
 		 160 aa  47.4  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  26.92 
 
 		 229 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  27.94 
 
 		 142 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0058  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.993982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1616  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1647  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.654975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  25.76 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  25.76 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  38.67 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  25.76 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  25.76 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  25.76 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001880  ADP compounds hydrolase NudE  29.37 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 		 130 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  25.76 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  38.53 
 
 		 231 aa  45.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  25.76 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2213  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121469  normal  0.536334 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  38.67 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  38.67 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 152 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0924  NUDIX hydrolase  28.3 
 
 		 133 aa  45.4  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  31.11 
 
 		 212 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  32.62 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  38.66 
 
 		 197 aa  45.1  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  29.53 
 
 		 162 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  25 
 
 		 153 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 144 aa  45.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 		 181 aa  45.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 		 142 aa  44.7  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00613  ADP-ribose diphosphatase NudE  29.37 
 
 		 188 aa  44.7  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  33.88 
 
 		 149 aa  44.7  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3309  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 153 aa  44.7  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2784  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 141 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.801073  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4727  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.28 
 
 		 170 aa  44.3  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78787  normal  0.0128864 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  25 
 
 		 153 aa  44.7  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  33.33 
 
 		 524 aa  44.3  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2689  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 141 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 215 aa  44.3  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  37.23 
 
 		 141 aa  44.3  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  30.22 
 
 		 167 aa  44.3  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  30.34 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  44.44 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  29.1 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  47.06 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  47.06 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  24.68 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>