138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1616 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1616  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 196 aa  397  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1329  NUDIX hydrolase  79.79 
 
 		 195 aa  311  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4819  NUDIX hydrolase  45.19 
 
 		 220 aa  168  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0545457  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1442  NUDIX hydrolase  45.74 
 
 		 202 aa  154  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000012981  normal  0.149266 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  33.06 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1217  NUDIX hydrolase  28.85 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00806683  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 		 286 aa  52.4  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 288 aa  52.8  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 139 aa  50.8  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 		 382 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 137 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1821  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.54 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0447  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.54 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0714  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.54 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.429601  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0903  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.54 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.332961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 341 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1432  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.54 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1643  NUDIX family hydrolase  41.54 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1666  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.54 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 		 261 aa  48.1  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4236  NAD(+) diphosphatase  37.88 
 
 		 321 aa  48.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0400368  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2899  NUDIX hydrolase  51.92 
 
 		 315 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0947619  normal  0.0271253 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 		 317 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2251  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 158 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0170  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 		 327 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 		 317 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3851  NADH pyrophosphatase  34.74 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0457  NADH pyrophosphatase  34.74 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159305 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0349  NADH pyrophosphatase  34.74 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389702  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  34.67 
 
 		 283 aa  47.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0222  NADH pyrophosphatase  31.25 
 
 		 260 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.740149  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 278 aa  46.6  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 141 aa  46.6  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1407  NADH pyrophosphatase  36.36 
 
 		 311 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  50 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 		 136 aa  46.2  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1425  NADH pyrophosphatase  36.36 
 
 		 311 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1461  NADH pyrophosphatase  36.36 
 
 		 311 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 305 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 		 150 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2657  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.46 
 
 		 184 aa  45.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  54 
 
 		 145 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0527  hypothetical protein  32.71 
 
 		 326 aa  45.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0926831  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  34.09 
 
 		 269 aa  45.4  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4444  NADH pyrophosphatase  35.42 
 
 		 257 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00022732 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0415  NTP pyrophosphohydrolase  32.93 
 
 		 289 aa  45.1  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.362153  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0522  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 		 317 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0294847  normal  0.653584 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 149 aa  45.1  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03873  NADH pyrophosphatase  35.42 
 
 		 257 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3998  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 257 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03826  hypothetical protein  35.42 
 
 		 257 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4230  NADH pyrophosphatase  35.42 
 
 		 257 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4539  NADH pyrophosphatase  35.42 
 
 		 257 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4029  NADH pyrophosphatase  35.42 
 
 		 257 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869322 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4487  NADH pyrophosphatase  35.42 
 
 		 257 aa  45.1  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  29.35 
 
 		 307 aa  44.7  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 		 323 aa  44.7  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3868  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 327 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558102  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15070  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  34.85 
 
 		 329 aa  44.3  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1777  NAD(+) diphosphatase  37.88 
 
 		 282 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 318 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5465  NADH pyrophosphatase  35.42 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.655268 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0617  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 310 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.348665  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  31.01 
 
 		 314 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1315  putative phosphatase  36.92 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0930  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3316  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 323 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1292  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.387319  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1412  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533482  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4662  NADH pyrophosphatase  34.85 
 
 		 308 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836669  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0209  NADH pyrophosphatase  34.38 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0313509 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  31.01 
 
 		 314 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0019  NADH pyrophosphatase-like protein  34.67 
 
 		 327 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159439  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1331  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.051474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3498  NAD(+) diphosphatase  31.82 
 
 		 310 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158806  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 138 aa  42.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4410  NADH pyrophosphatase  34.38 
 
 		 257 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.172037  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1950  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 255 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  hitchhiker  0.00341622 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  31.08 
 
 		 261 aa  43.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0810  NUDIX hydrolase  29.9 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3868  NADH pyrophosphatase  32 
 
 		 257 aa  43.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1805  NADH pyrophosphatase  34.85 
 
 		 308 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106205  normal  0.106222 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 		 294 aa  42.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  33.77 
 
 		 147 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2733  NADH pyrophosphatase  34.48 
 
 		 269 aa  42.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 		 315 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 		 147 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  31.01 
 
 		 314 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27580  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  35.53 
 
 		 331 aa  43.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0218  NADH pyrophosphatase  30.84 
 
 		 260 aa  43.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  37.88 
 
 		 303 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  34.78 
 
 		 303 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3557  mutT/nudix family protein  40.32 
 
 		 131 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239001  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0108  mutT/nudix family protein  29.2 
 
 		 321 aa  42.4  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>