99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1329 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1329  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 195 aa  390  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1616  NUDIX hydrolase  79.79 
 
 		 196 aa  311  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4819  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 		 220 aa  160  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0545457  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1442  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000012981  normal  0.149266 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1217  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00806683  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  34.09 
 
 		 260 aa  52.4  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 		 382 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 288 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 261 aa  48.9  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 		 317 aa  48.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 		 317 aa  47.8  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2251  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 		 158 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 		 286 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4236  NAD(+) diphosphatase  36.62 
 
 		 321 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0400368  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1821  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  52.27 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1666  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  52.27 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1643  NUDIX family hydrolase  52.27 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0447  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  52.27 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1432  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  52.27 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0714  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  52.27 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.429601  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0903  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  52.27 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.332961  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0522  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 		 317 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0294847  normal  0.653584 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3851  NADH pyrophosphatase  32.81 
 
 		 260 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  34.88 
 
 		 149 aa  45.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0349  NADH pyrophosphatase  32.81 
 
 		 260 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389702  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4444  NADH pyrophosphatase  35.19 
 
 		 257 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00022732 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3868  NADH pyrophosphatase  30.65 
 
 		 257 aa  45.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3498  NAD(+) diphosphatase  30.67 
 
 		 310 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158806  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1461  NADH pyrophosphatase  33.33 
 
 		 311 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0457  NADH pyrophosphatase  32.81 
 
 		 260 aa  45.4  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159305 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1425  NADH pyrophosphatase  33.33 
 
 		 311 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1407  NADH pyrophosphatase  33.33 
 
 		 311 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  35.34 
 
 		 303 aa  45.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 		 341 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0415  NTP pyrophosphohydrolase  35.8 
 
 		 289 aa  45.4  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.362153  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0222  NADH pyrophosphatase  32.74 
 
 		 260 aa  45.1  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.740149  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 318 aa  45.1  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 138 aa  44.7  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4029  NADH pyrophosphatase  34.26 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869322 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 		 139 aa  44.3  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  43.06 
 
 		 278 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4487  NADH pyrophosphatase  34.26 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5465  NADH pyrophosphatase  34.26 
 
 		 257 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.655268 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03826  hypothetical protein  34.26 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3998  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4539  NADH pyrophosphatase  34.26 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  33.7 
 
 		 314 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03873  NADH pyrophosphatase  34.26 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1777  NAD(+) diphosphatase  34.43 
 
 		 282 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0170  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 327 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  33.7 
 
 		 314 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4230  NADH pyrophosphatase  34.26 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0617  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 310 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.348665  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 141 aa  43.5  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4573  NADH pyrophosphatase  34.26 
 
 		 257 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.117835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4410  NADH pyrophosphatase  34.26 
 
 		 257 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.172037  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2657  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  47.73 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4499  NADH pyrophosphatase  34.26 
 
 		 257 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461248  hitchhiker  0.000431337 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  30.7 
 
 		 343 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1584  NAD(+) diphosphatase  32.95 
 
 		 330 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0238649  normal  0.338548 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2899  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 315 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0947619  normal  0.0271253 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1805  NADH pyrophosphatase  30.48 
 
 		 308 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106205  normal  0.106222 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 294 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4497  NADH pyrophosphatase  34.26 
 
 		 257 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0213406 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4662  NADH pyrophosphatase  32 
 
 		 308 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836669  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  33.7 
 
 		 314 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  34.09 
 
 		 303 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0865  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 		 319 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3868  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 327 aa  42.7  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558102  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0218  NADH pyrophosphatase  32.41 
 
 		 260 aa  42.7  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3714  NADH pyrophosphatase  30.65 
 
 		 257 aa  42.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.506766  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  32.08 
 
 		 307 aa  42.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 298 aa  42.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 167 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 298 aa  42.4  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 		 140 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 		 128 aa  42  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0108  mutT/nudix family protein  29.41 
 
 		 321 aa  42  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4377  NADH pyrophosphatase  33.33 
 
 		 257 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0670  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 310 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.479149 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  32.22 
 
 		 130 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0717  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 168 aa  41.6  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  36.49 
 
 		 315 aa  41.6  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1680  hypothetical protein  38.81 
 
 		 269 aa  41.6  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  30.84 
 
 		 135 aa  41.6  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  32.58 
 
 		 314 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  34.52 
 
 		 282 aa  41.6  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  28.04 
 
 		 283 aa  41.6  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 		 150 aa  41.2  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0019  NADH pyrophosphatase-like protein  37.65 
 
 		 327 aa  41.2  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159439  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0209  NADH pyrophosphatase  30.84 
 
 		 258 aa  41.2  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0313509 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  30.12 
 
 		 261 aa  41.2  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  32.22 
 
 		 140 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.41 
 
 		 134 aa  41.2  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 153 aa  41.2  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0336  NUDIX hydrolase  26.24 
 
 		 261 aa  41.2  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0738056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4220  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 304 aa  41.2  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288399  normal  0.0172337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>