More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6646 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 155 aa  320  5e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4226  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 		 162 aa  110  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  63.41 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  45.71 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1148  hypothetical protein  29.46 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504849  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2655  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  45.1 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 		 218 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  39.74 
 
 		 181 aa  52  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  45.71 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10418  mutator protein mutT3  29.27 
 
 		 217 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0449167  normal  0.708231 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6876  putative ATP/GTP-binding protein  41.27 
 
 		 175 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  40.98 
 
 		 316 aa  50.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  25.93 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  45.9 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1502  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.519776 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  52.27 
 
 		 253 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  45.9 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  45.9 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  45.9 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  45.9 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 188 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 		 209 aa  48.9  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  44.68 
 
 		 255 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  29.01 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  45.9 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  29.9 
 
 		 139 aa  48.5  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1950  hypothetical protein  35.48 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00937035  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  32.65 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0064  putative ATP/GTP-binding protein  43.75 
 
 		 157 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  33.93 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 299 aa  47.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1103  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 169 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23100  hypothetical protein  35.48 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.691399  hitchhiker  0.00085888 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003180  MutT/nudix family protein  40.68 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  48.08 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0933  hypothetical protein  47.92 
 
 		 209 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0616  mutT/nudix family protein  44.26 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2431  MutT/Nudix family protein  37.5 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000214023  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4760  mutT/nudix family protein  33.96 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000960716  hitchhiker  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3492  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  36.14 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  43.1 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  52.94 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2721  mutT/nudix family protein  37.93 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00212915  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2500  mutT/nudix family protein  37.5 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0522279  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2685  mutT/nudix family protein  37.5 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345064  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2885  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755007  normal  0.649673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2700  mutT/nudix family protein  37.5 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000999675 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  44.68 
 
 		 212 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0533  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0555  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51062  normal  0.852901 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  37.7 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  43.18 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1300  NUDIX family hydrolase  50 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.898276  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  39.66 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0543  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.643343  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 216 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1436  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 291 aa  45.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4123  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 181 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  37.7 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6325  NUDIX hydrolase  32.47 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662138 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2751  MutT/Nudix family protein  35.94 
 
 		 194 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000576438  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  32.41 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>