62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1436 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1436  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 141 aa  291  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6325  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662138 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1502  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 139 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.519776 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1974  MutT/nudix family protein  43.94 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1950  hypothetical protein  40.91 
 
 		 145 aa  124  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00937035  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23100  hypothetical protein  40.91 
 
 		 145 aa  124  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.691399  hitchhiker  0.00085888 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0195  ADP-ribose pyrophosphatase  45.04 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0058  NUDIX hydrolase  44.88 
 
 		 183 aa  109  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.993982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0128  NUDIX hydrolase  47.73 
 
 		 139 aa  103  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0968691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2319  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.734141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1259  hypothetical protein  44.29 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0924  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  35.79 
 
 		 525 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  48.94 
 
 		 565 aa  50.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1148  hypothetical protein  38.03 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504849  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  34.23 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36667  predicted protein  53.85 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.179207 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0906  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000252658  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  44.44 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  43.55 
 
 		 360 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  34.25 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2701  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0393532  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  40.43 
 
 		 310 aa  44.7  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  42.37 
 
 		 320 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  37.93 
 
 		 320 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1799  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000483875  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  54.76 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  30.61 
 
 		 306 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1017  NUDIX family protein  47.17 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.686526  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2902  NUDIX hydrolase  31.63 
 
 		 219 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00219034  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 167 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  48.65 
 
 		 329 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  47.22 
 
 		 363 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  48.65 
 
 		 329 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2293  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 		 162 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.843226  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 		 291 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  36.36 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  38.1 
 
 		 255 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  40.26 
 
 		 282 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  37.14 
 
 		 570 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 134 aa  41.2  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  28 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0730  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 153 aa  40.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.189359  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  50 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  38.46 
 
 		 212 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1196  mutator MutT protein  32.53 
 
 		 160 aa  40.4  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  27.36 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1033  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 161 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.997989 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2062  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.894699  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4142  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 173 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  41.27 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0292  hypothetical protein  33.96 
 
 		 147 aa  40  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0394428 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>