78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_23100 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_23100  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  293  7e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.691399  hitchhiker  0.00085888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1950  hypothetical protein  98.62 
 
 		 145 aa  286  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00937035  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1502  NUDIX hydrolase  54.74 
 
 		 139 aa  149  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.519776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6325  NUDIX hydrolase  53.24 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662138 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1974  MutT/nudix family protein  43.51 
 
 		 152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0195  ADP-ribose pyrophosphatase  43.07 
 
 		 148 aa  127  6e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0128  NUDIX hydrolase  52.52 
 
 		 139 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0968691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1436  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 141 aa  124  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0058  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 		 183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.993982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2319  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.734141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1259  hypothetical protein  42.62 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0924  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 133 aa  50.4  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  44.9 
 
 		 525 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1148  hypothetical protein  38.6 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504849  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  31.25 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  29.84 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.95 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  28.43 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  32.84 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  44.44 
 
 		 565 aa  44.7  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  32.06 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 129 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  32.06 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0384  hypothetical protein  26.43 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233083  normal  0.983656 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0906  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000252658  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1300  NUDIX family hydrolase  38.6 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.898276  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  34.38 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  29.41 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  35.92 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  44 
 
 		 329 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  47.62 
 
 		 316 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2751  MutT/Nudix family protein  27.84 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000576438  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  44 
 
 		 329 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  32.67 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  37.88 
 
 		 310 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  33.03 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  36.47 
 
 		 138 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  36.47 
 
 		 138 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  42.59 
 
 		 129 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  31.07 
 
 		 149 aa  41.6  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 143 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  46.15 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 		 291 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  32.73 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2431  MutT/Nudix family protein  28.43 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000214023  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2500  mutT/nudix family protein  30.38 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0522279  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  33.87 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10531  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 141 aa  40.8  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2685  mutT/nudix family protein  30.38 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1856  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.015208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2700  mutT/nudix family protein  30.38 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000999675 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  42.86 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1038  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.38743 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.68 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.68 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 		 198 aa  40.8  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0999  hypothetical protein  28.81 
 
 		 341 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.277961  normal  0.723054 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  28.16 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  37.04 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29780  ADP-ribose pyrophosphatase  37.84 
 
 		 163 aa  40.4  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.26 
 
 		 362 aa  40.4  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 146 aa  40  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 126 aa  40  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  43.64 
 
 		 144 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>