76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_10531 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_10531  NUDIX hydrolase  100 
 
 
141 aa  283  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1017  NUDIX family protein  61.15 
 
 
139 aa  170  7.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.686526  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1482  NUDIX family protein  59.71 
 
 
143 aa  167  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0365982  normal  0.462774 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1615  NUDIX hydrolase  43.9 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1590  NUDIX hydrolase  43.09 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0038  mutator MutT protein  44.85 
 
 
158 aa  111  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.934517  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0605  NUDIX hydrolase  43.31 
 
 
147 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1038  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 
144 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.38743 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4170  NUDIX hydrolase  45.54 
 
 
151 aa  98.2  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.258691 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2701  NUDIX hydrolase  44.35 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0393532  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1508  NUDIX hydrolase  39.37 
 
 
132 aa  91.3  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  55.77 
 
 
166 aa  57.4  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  43.94 
 
 
565 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
525 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1259  hypothetical protein  45.45 
 
 
153 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  30 
 
 
140 aa  52  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0924  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 
133 aa  51.2  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  33.8 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3755  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 
157 aa  47  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  30.19 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1974  MutT/nudix family protein  28.57 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  41.1 
 
 
329 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  41.1 
 
 
329 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  36.45 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 
197 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  38.18 
 
 
360 aa  44.3  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0595  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
156 aa  44.3  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.652543 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  36.45 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
291 aa  44.3  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0058  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 
183 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.993982  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  31.69 
 
 
137 aa  43.5  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1950  hypothetical protein  37.1 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00937035  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1148  hypothetical protein  38.98 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504849  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7624  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  36.11 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 
221 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0141  ADP-ribose diphosphatase NudE  43.4 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  36.36 
 
 
136 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 
151 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 
138 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  32.65 
 
 
173 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0160  ADP-ribose diphosphatase NudE  43.4 
 
 
182 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  42 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 
221 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23100  hypothetical protein  39.29 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.691399  hitchhiker  0.00085888 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3080  ADP-ribose diphosphatase NudE  34.94 
 
 
187 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0428  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 
166 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5187  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 
171 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.466723  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2861  NUDIX hydrolase  45.9 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.36 
 
 
128 aa  40.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.36 
 
 
128 aa  40.4  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.36 
 
 
128 aa  40.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  43.64 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  43.86 
 
 
153 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1169  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2546  NUDIX family hydrolase  38.36 
 
 
141 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  43.64 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32 
 
 
131 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  45.76 
 
 
334 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  38.89 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
187 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32 
 
 
131 aa  40  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0292  hypothetical protein  53.33 
 
 
147 aa  40  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0394428 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>