287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0160 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0160  ADP-ribose diphosphatase NudE  100 
 
 
182 aa  367  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0141  ADP-ribose diphosphatase NudE  99.45 
 
 
182 aa  365  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01648  ADP-ribose diphosphatase NudE  76.54 
 
 
182 aa  288  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.541498  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3080  ADP-ribose diphosphatase NudE  75.84 
 
 
187 aa  275  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3623  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.57 
 
 
182 aa  191  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2418  NUDIX hydrolase  53.33 
 
 
181 aa  190  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03971  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.72 
 
 
187 aa  184  9e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.222226  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0119  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.71 
 
 
185 aa  180  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00596251  normal  0.391787 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2420  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.45 
 
 
184 aa  179  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2931  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.42 
 
 
180 aa  174  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0138  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.41 
 
 
187 aa  174  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3810  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.74 
 
 
186 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3693  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.89 
 
 
187 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3863  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.89 
 
 
198 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3766  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.89 
 
 
198 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3800  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.89 
 
 
198 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3691  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.89 
 
 
198 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0424  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.71 
 
 
183 aa  165  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0224  ADP-ribose diphosphatase NudE  50 
 
 
184 aa  165  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03249  ADP-ribose diphosphatase  46.33 
 
 
186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0316  NUDIX hydrolase  46.33 
 
 
186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03201  hypothetical protein  46.33 
 
 
186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3774  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.33 
 
 
186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3674  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.33 
 
 
186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.251567  normal  0.322169 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0316  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.33 
 
 
186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.155326 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4702  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.33 
 
 
186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.631094  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3592  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.33 
 
 
186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3868  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.33 
 
 
186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1467  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.64 
 
 
187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.858308  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2294  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.04 
 
 
204 aa  162  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2302  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.17 
 
 
186 aa  161  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2275  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.17 
 
 
186 aa  161  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4718  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.22 
 
 
181 aa  159  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001880  ADP compounds hydrolase NudE  46.07 
 
 
189 aa  158  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00613  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.56 
 
 
188 aa  158  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0252  ADP-ribose diphosphatase NudE  44.02 
 
 
190 aa  157  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0370  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.6 
 
 
199 aa  156  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.174333 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0524  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.24 
 
 
192 aa  155  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2059  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.37 
 
 
196 aa  155  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4068  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.4 
 
 
185 aa  153  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3890  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.4 
 
 
185 aa  153  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4188  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.29 
 
 
183 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0167  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.55 
 
 
193 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2913  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.05 
 
 
183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0171  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.55 
 
 
183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0260  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.04 
 
 
188 aa  151  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0135852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0275  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.04 
 
 
188 aa  151  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4950  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.04 
 
 
188 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  hitchhiker  0.0000179344 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0129  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.43 
 
 
181 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0285  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.49 
 
 
188 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4346  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.83 
 
 
181 aa  150  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0156  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.29 
 
 
184 aa  150  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00016487  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0183  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.33 
 
 
183 aa  150  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.29 
 
 
183 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.29 
 
 
183 aa  149  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00239764  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0284  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.7 
 
 
188 aa  148  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.304837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0164  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.29 
 
 
183 aa  148  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3549  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.29 
 
 
183 aa  148  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0331  ADP-ribose diphosphatase NudE  43.65 
 
 
184 aa  147  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05490  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.23 
 
 
188 aa  147  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00271926  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68380  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.49 
 
 
188 aa  147  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000374463  normal  0.555558 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5916  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.49 
 
 
188 aa  147  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0117  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.98 
 
 
195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0393  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.81 
 
 
188 aa  143  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0014  ADP-ribose diphosphatase NudE  38.86 
 
 
181 aa  140  9.999999999999999e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0190  ADP-ribose diphosphatase NudE  48 
 
 
183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1756  ADP-ribose diphosphatase NudE  40 
 
 
183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4612  ADP-ribose diphosphatase NudE  41.95 
 
 
184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5402  mutT/nudix family protein  47.27 
 
 
188 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4941  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.27 
 
 
188 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0180  ADP-ribose diphosphatase NudE  40.91 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3973  ADP-ribose diphosphatase NudE  40.91 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3734  ADP-ribose diphosphatase NudE  40.91 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2661  ADP-ribose diphosphatase NudE  42.47 
 
 
211 aa  131  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283798  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  28.4 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  32.62 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  27.75 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  28.49 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  32.03 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  30.47 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  28.06 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  27.12 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  27.33 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  26.97 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  27.22 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  22.6 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  25.88 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  28.79 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  29.76 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>