More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0393 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0393  ADP-ribose diphosphatase NudE  100 
 
 		 188 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68380  ADP-ribose diphosphatase NudE  86.63 
 
 		 188 aa  330  8e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000374463  normal  0.555558 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5916  ADP-ribose diphosphatase NudE  86.63 
 
 		 188 aa  330  8e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05490  ADP-ribose diphosphatase NudE  83.7 
 
 		 188 aa  321  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00271926  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0260  ADP-ribose diphosphatase NudE  84.78 
 
 		 188 aa  320  7e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0135852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0275  ADP-ribose diphosphatase NudE  84.78 
 
 		 188 aa  320  7e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4950  ADP-ribose diphosphatase NudE  84.24 
 
 		 188 aa  318  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  hitchhiker  0.0000179344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0285  ADP-ribose diphosphatase NudE  84.24 
 
 		 188 aa  317  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0284  ADP-ribose diphosphatase NudE  81.82 
 
 		 188 aa  315  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304837 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5402  mutT/nudix family protein  84.04 
 
 		 188 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4941  ADP-ribose diphosphatase NudE  84.57 
 
 		 188 aa  302  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2661  ADP-ribose diphosphatase NudE  60.34 
 
 		 211 aa  209  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283798  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0183  ADP-ribose diphosphatase NudE  54.75 
 
 		 183 aa  187  7e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3766  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.2 
 
 		 198 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3863  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.2 
 
 		 198 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.81 
 
 		 183 aa  185  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0370  ADP-ribose diphosphatase NudE  54.64 
 
 		 199 aa  185  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174333 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.81 
 
 		 183 aa  185  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00239764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3800  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.2 
 
 		 198 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3691  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.2 
 
 		 198 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3549  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.96 
 
 		 183 aa  184  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3693  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.2 
 
 		 187 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0164  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.81 
 
 		 183 aa  184  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0156  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.2 
 
 		 184 aa  184  8e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00016487  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2302  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.85 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0171  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.96 
 
 		 183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0167  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.96 
 
 		 193 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4188  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.96 
 
 		 183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2931  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.11 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0224  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.11 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2275  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.31 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3810  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.1 
 
 		 186 aa  181  7e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4346  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.12 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4702  ADP-ribose diphosphatase NudE  50 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.631094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4718  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.57 
 
 		 181 aa  179  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0117  ADP-ribose diphosphatase NudE  50 
 
 		 195 aa  179  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03201  hypothetical protein  50 
 
 		 186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03249  ADP-ribose diphosphatase  50 
 
 		 186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0316  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3774  ADP-ribose diphosphatase NudE  50 
 
 		 186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3674  ADP-ribose diphosphatase NudE  50 
 
 		 186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.251567  normal  0.322169 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3592  ADP-ribose diphosphatase NudE  50 
 
 		 186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3868  ADP-ribose diphosphatase NudE  50 
 
 		 186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0316  ADP-ribose diphosphatase NudE  50 
 
 		 186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0129  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.69 
 
 		 181 aa  177  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0424  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.04 
 
 		 183 aa  176  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03971  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.16 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.222226  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1467  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.16 
 
 		 187 aa  175  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.858308  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0138  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.93 
 
 		 187 aa  175  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2420  ADP-ribose diphosphatase NudE  50 
 
 		 184 aa  174  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3623  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.27 
 
 		 182 aa  174  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0190  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.37 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3890  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.12 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0331  ADP-ribose diphosphatase NudE  50 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2913  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.72 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2059  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.4 
 
 		 196 aa  169  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4068  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.31 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2418  NUDIX hydrolase  49.16 
 
 		 181 aa  168  5e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0252  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.96 
 
 		 190 aa  165  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4612  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.19 
 
 		 184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00613  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.28 
 
 		 188 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0180  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.56 
 
 		 181 aa  160  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3973  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.56 
 
 		 181 aa  160  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0524  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.44 
 
 		 192 aa  160  8.000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3734  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.56 
 
 		 181 aa  160  8.000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2294  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.54 
 
 		 204 aa  158  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0119  ADP-ribose diphosphatase NudE  43.26 
 
 		 185 aa  158  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00596251  normal  0.391787 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0014  ADP-ribose diphosphatase NudE  42.7 
 
 		 181 aa  156  1e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001880  ADP compounds hydrolase NudE  46.55 
 
 		 189 aa  155  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01648  ADP-ribose diphosphatase NudE  50 
 
 		 182 aa  150  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.541498  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3080  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.38 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0160  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.81 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0141  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.15 
 
 		 182 aa  143  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1756  ADP-ribose diphosphatase NudE  38.8 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  28.42 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  29.24 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  26.01 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  28.02 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  26.51 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  26.51 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  27.85 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  31.14 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  27.06 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  23.53 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  28.57 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  29.48 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  24.39 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0212  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.465676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  29.09 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  29.09 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  29.09 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  29.09 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  28.33 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  29.09 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>