266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0316 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03249  ADP-ribose diphosphatase  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0316  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3774  ADP-ribose diphosphatase NudE  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03201  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0316  ADP-ribose diphosphatase NudE  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155326 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3868  ADP-ribose diphosphatase NudE  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4702  ADP-ribose diphosphatase NudE  99.46 
 
 		 186 aa  378  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.631094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3592  ADP-ribose diphosphatase NudE  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3674  ADP-ribose diphosphatase NudE  99.46 
 
 		 186 aa  377  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.251567  normal  0.322169 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3863  ADP-ribose diphosphatase NudE  92.47 
 
 		 198 aa  358  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3766  ADP-ribose diphosphatase NudE  92.47 
 
 		 198 aa  358  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3800  ADP-ribose diphosphatase NudE  92.47 
 
 		 198 aa  358  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3691  ADP-ribose diphosphatase NudE  92.47 
 
 		 198 aa  358  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3693  ADP-ribose diphosphatase NudE  92.47 
 
 		 187 aa  357  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3810  ADP-ribose diphosphatase NudE  91.4 
 
 		 186 aa  353  7.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4612  ADP-ribose diphosphatase NudE  80.22 
 
 		 184 aa  298  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3890  ADP-ribose diphosphatase NudE  75.14 
 
 		 185 aa  290  7e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4068  ADP-ribose diphosphatase NudE  74.59 
 
 		 185 aa  287  7e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0331  ADP-ribose diphosphatase NudE  73.89 
 
 		 184 aa  278  5e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0252  ADP-ribose diphosphatase NudE  73.22 
 
 		 190 aa  277  6e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3734  ADP-ribose diphosphatase NudE  74.72 
 
 		 181 aa  276  9e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3973  ADP-ribose diphosphatase NudE  74.72 
 
 		 181 aa  276  9e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0180  ADP-ribose diphosphatase NudE  74.72 
 
 		 181 aa  276  9e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0014  ADP-ribose diphosphatase NudE  63.54 
 
 		 181 aa  244  4.9999999999999997e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2913  ADP-ribose diphosphatase NudE  63.69 
 
 		 183 aa  230  9e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3549  ADP-ribose diphosphatase NudE  62.43 
 
 		 183 aa  229  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0167  ADP-ribose diphosphatase NudE  63.33 
 
 		 193 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4188  ADP-ribose diphosphatase NudE  62.98 
 
 		 183 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0171  ADP-ribose diphosphatase NudE  63.33 
 
 		 183 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2294  ADP-ribose diphosphatase NudE  63.19 
 
 		 204 aa  228  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0117  ADP-ribose diphosphatase NudE  61.11 
 
 		 195 aa  226  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  60.77 
 
 		 183 aa  226  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  60.77 
 
 		 183 aa  226  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00239764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0164  ADP-ribose diphosphatase NudE  60.22 
 
 		 183 aa  224  6e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001880  ADP compounds hydrolase NudE  60.92 
 
 		 189 aa  223  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0224  ADP-ribose diphosphatase NudE  57.22 
 
 		 184 aa  223  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0183  ADP-ribose diphosphatase NudE  60.56 
 
 		 183 aa  223  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0156  ADP-ribose diphosphatase NudE  59.89 
 
 		 184 aa  220  8e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00016487  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0129  ADP-ribose diphosphatase NudE  60.8 
 
 		 181 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00613  ADP-ribose diphosphatase NudE  60 
 
 		 188 aa  220  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4718  ADP-ribose diphosphatase NudE  59.89 
 
 		 181 aa  216  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4346  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.76 
 
 		 181 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03971  ADP-ribose diphosphatase NudE  59.89 
 
 		 187 aa  215  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.222226  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0138  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.76 
 
 		 187 aa  214  7e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0190  ADP-ribose diphosphatase NudE  60.22 
 
 		 183 aa  208  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0119  ADP-ribose diphosphatase NudE  57.47 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00596251  normal  0.391787 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0424  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.93 
 
 		 183 aa  196  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2302  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.84 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2275  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.84 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2931  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.81 
 
 		 180 aa  187  8e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3623  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.57 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2420  ADP-ribose diphosphatase NudE  52 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0284  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.55 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0260  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.65 
 
 		 188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0135852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0393  ADP-ribose diphosphatase NudE  50 
 
 		 188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0275  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.65 
 
 		 188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4950  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.65 
 
 		 188 aa  177  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  hitchhiker  0.0000179344 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05490  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.9 
 
 		 188 aa  176  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00271926  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1467  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.04 
 
 		 187 aa  176  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.858308  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2059  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.15 
 
 		 196 aa  177  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5402  mutT/nudix family protein  53.3 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68380  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.25 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000374463  normal  0.555558 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5916  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.25 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0285  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.1 
 
 		 188 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2418  NUDIX hydrolase  48.88 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4941  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.2 
 
 		 188 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0524  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.3 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0370  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.72 
 
 		 199 aa  167  6e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174333 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01648  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.93 
 
 		 182 aa  167  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.541498  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3080  ADP-ribose diphosphatase NudE  50 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2661  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.09 
 
 		 211 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283798  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0141  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.33 
 
 		 182 aa  164  6.9999999999999995e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0160  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.33 
 
 		 182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1756  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.05 
 
 		 183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  30.06 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  27.52 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1402  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173305  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  27.84 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  24.7 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  25.42 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  29.2 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  22.91 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  27.81 
 
 		 208 aa  62  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  26.11 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  28.14 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01790  NTP pyrophosphohydrolase  39.56 
 
 		 274 aa  61.2  0.000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  27.21 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  24.86 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  28.14 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  26.74 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  27.61 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  22.91 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>