More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0117 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0117  ADP-ribose diphosphatase NudE  100 
 
 		 195 aa  402  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  84.53 
 
 		 183 aa  325  3e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  84.53 
 
 		 183 aa  325  3e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00239764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0164  ADP-ribose diphosphatase NudE  84.53 
 
 		 183 aa  323  7e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0167  ADP-ribose diphosphatase NudE  85 
 
 		 193 aa  323  1e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4188  ADP-ribose diphosphatase NudE  84.53 
 
 		 183 aa  323  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0171  ADP-ribose diphosphatase NudE  85 
 
 		 183 aa  322  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3549  ADP-ribose diphosphatase NudE  83.89 
 
 		 183 aa  320  9.000000000000001e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0224  ADP-ribose diphosphatase NudE  81.87 
 
 		 184 aa  314  4e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0190  ADP-ribose diphosphatase NudE  82.22 
 
 		 183 aa  303  9.000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0183  ADP-ribose diphosphatase NudE  77.9 
 
 		 183 aa  291  3e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0156  ADP-ribose diphosphatase NudE  76.37 
 
 		 184 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00016487  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0129  ADP-ribose diphosphatase NudE  76.7 
 
 		 181 aa  280  9e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4718  ADP-ribose diphosphatase NudE  74.72 
 
 		 181 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4346  ADP-ribose diphosphatase NudE  74.3 
 
 		 181 aa  268  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2913  ADP-ribose diphosphatase NudE  66.29 
 
 		 183 aa  236  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3691  ADP-ribose diphosphatase NudE  61.54 
 
 		 198 aa  231  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3800  ADP-ribose diphosphatase NudE  61.54 
 
 		 198 aa  231  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3766  ADP-ribose diphosphatase NudE  61.54 
 
 		 198 aa  231  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3863  ADP-ribose diphosphatase NudE  61.54 
 
 		 198 aa  231  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3693  ADP-ribose diphosphatase NudE  61.54 
 
 		 187 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4702  ADP-ribose diphosphatase NudE  61.11 
 
 		 186 aa  226  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.631094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2294  ADP-ribose diphosphatase NudE  63.64 
 
 		 204 aa  227  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03249  ADP-ribose diphosphatase  61.11 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0316  NUDIX hydrolase  61.11 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3674  ADP-ribose diphosphatase NudE  61.11 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.251567  normal  0.322169 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03201  hypothetical protein  61.11 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0316  ADP-ribose diphosphatase NudE  61.11 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155326 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3810  ADP-ribose diphosphatase NudE  60.77 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3868  ADP-ribose diphosphatase NudE  61.11 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3774  ADP-ribose diphosphatase NudE  61.11 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3592  ADP-ribose diphosphatase NudE  61.11 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4612  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.56 
 
 		 184 aa  221  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00613  ADP-ribose diphosphatase NudE  57.14 
 
 		 188 aa  221  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001880  ADP compounds hydrolase NudE  57.84 
 
 		 189 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0252  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.89 
 
 		 190 aa  218  6e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0331  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.01 
 
 		 184 aa  216  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3890  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.15 
 
 		 185 aa  216  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4068  ADP-ribose diphosphatase NudE  57.61 
 
 		 185 aa  215  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0424  ADP-ribose diphosphatase NudE  57.46 
 
 		 183 aa  214  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0180  ADP-ribose diphosphatase NudE  57.95 
 
 		 181 aa  214  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3973  ADP-ribose diphosphatase NudE  57.95 
 
 		 181 aa  214  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3734  ADP-ribose diphosphatase NudE  57.95 
 
 		 181 aa  214  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2931  ADP-ribose diphosphatase NudE  56.5 
 
 		 180 aa  214  7e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03971  ADP-ribose diphosphatase NudE  56.9 
 
 		 187 aa  210  7.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.222226  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0119  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.86 
 
 		 185 aa  210  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00596251  normal  0.391787 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0138  ADP-ribose diphosphatase NudE  57.47 
 
 		 187 aa  206  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2059  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.49 
 
 		 196 aa  201  6e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0370  ADP-ribose diphosphatase NudE  54.49 
 
 		 199 aa  198  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174333 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2302  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.98 
 
 		 186 aa  195  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2275  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.98 
 
 		 186 aa  195  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0014  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.11 
 
 		 181 aa  195  3e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3623  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.86 
 
 		 182 aa  187  9e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0284  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.78 
 
 		 188 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304837 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2420  ADP-ribose diphosphatase NudE  50 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4950  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.51 
 
 		 188 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  hitchhiker  0.0000179344 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05490  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.28 
 
 		 188 aa  181  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00271926  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0260  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.4 
 
 		 188 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0135852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5916  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.44 
 
 		 188 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68380  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.44 
 
 		 188 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000374463  normal  0.555558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0275  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.4 
 
 		 188 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0393  ADP-ribose diphosphatase NudE  50 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0285  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.4 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2418  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 		 181 aa  178  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1467  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.71 
 
 		 187 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.858308  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0524  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.99 
 
 		 192 aa  175  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5402  mutT/nudix family protein  52.22 
 
 		 188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4941  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.22 
 
 		 188 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1756  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.93 
 
 		 183 aa  170  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2661  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.28 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283798  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3080  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.58 
 
 		 187 aa  152  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01648  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.5 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.541498  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0141  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.98 
 
 		 182 aa  147  7e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0160  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.98 
 
 		 182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  31.55 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  31.55 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  27.96 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  31.55 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  29.24 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  27.42 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  28.49 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  25.37 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  26.55 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  28.57 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  26.58 
 
 		 176 aa  72  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  28.4 
 
 		 166 aa  72  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  29.28 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  27.49 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0185  hypothetical protein  29.78 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.533354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  25.28 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  26.32 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  27.93 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>