More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2302 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2302  ADP-ribose diphosphatase NudE  100 
 
 
186 aa  380  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2275  ADP-ribose diphosphatase NudE  99.46 
 
 
186 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0167  ADP-ribose diphosphatase NudE  54.24 
 
 
193 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0171  ADP-ribose diphosphatase NudE  54.24 
 
 
183 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4188  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.93 
 
 
183 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0117  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.98 
 
 
195 aa  195  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0183  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.93 
 
 
183 aa  195  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0138  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.54 
 
 
187 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.11 
 
 
183 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.11 
 
 
183 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00239764  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3863  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.07 
 
 
198 aa  194  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3800  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.07 
 
 
198 aa  194  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3691  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.07 
 
 
198 aa  194  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3766  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.07 
 
 
198 aa  194  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4702  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.84 
 
 
186 aa  193  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.631094  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0164  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.11 
 
 
183 aa  193  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3693  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.07 
 
 
187 aa  193  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03249  ADP-ribose diphosphatase  52.84 
 
 
186 aa  192  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0316  NUDIX hydrolase  52.84 
 
 
186 aa  192  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0129  ADP-ribose diphosphatase NudE  54.8 
 
 
181 aa  192  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3674  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.84 
 
 
186 aa  192  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.251567  normal  0.322169 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3592  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.84 
 
 
186 aa  192  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0316  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.84 
 
 
186 aa  192  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.155326 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3868  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.84 
 
 
186 aa  192  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03201  hypothetical protein  52.84 
 
 
186 aa  192  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3774  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.84 
 
 
186 aa  192  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0424  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.45 
 
 
183 aa  191  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3890  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.69 
 
 
185 aa  191  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0224  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.12 
 
 
184 aa  191  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3810  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.98 
 
 
186 aa  191  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4068  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.98 
 
 
185 aa  190  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2294  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.37 
 
 
204 aa  189  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0156  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.81 
 
 
184 aa  189  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00016487  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2913  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.51 
 
 
183 aa  189  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3549  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.12 
 
 
183 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03971  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.41 
 
 
187 aa  187  9e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.222226  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0370  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.46 
 
 
199 aa  187  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.174333 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0252  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.72 
 
 
190 aa  186  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0331  ADP-ribose diphosphatase NudE  50 
 
 
184 aa  186  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4346  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.86 
 
 
181 aa  184  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0119  ADP-ribose diphosphatase NudE  50 
 
 
185 aa  184  7e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00596251  normal  0.391787 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0190  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.11 
 
 
183 aa  184  8e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0393  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.85 
 
 
188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4718  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.28 
 
 
181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4612  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.57 
 
 
184 aa  182  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5916  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.31 
 
 
188 aa  180  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68380  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.31 
 
 
188 aa  180  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000374463  normal  0.555558 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2059  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.28 
 
 
196 aa  177  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00613  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.84 
 
 
188 aa  177  9e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2931  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.28 
 
 
180 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1467  ADP-ribose diphosphatase NudE  48 
 
 
187 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.858308  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3734  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.59 
 
 
181 aa  176  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3973  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.59 
 
 
181 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0180  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.59 
 
 
181 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001880  ADP compounds hydrolase NudE  51.41 
 
 
189 aa  175  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0284  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.99 
 
 
188 aa  174  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.304837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0260  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.54 
 
 
188 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0135852 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2418  NUDIX hydrolase  49.44 
 
 
181 aa  173  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0275  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.54 
 
 
188 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05490  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.41 
 
 
188 aa  170  9e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00271926  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0285  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.99 
 
 
188 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4950  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.45 
 
 
188 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  hitchhiker  0.0000179344 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01648  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.38 
 
 
182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.541498  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3623  ADP-ribose diphosphatase NudE  43.41 
 
 
182 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0141  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.17 
 
 
182 aa  162  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0160  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.17 
 
 
182 aa  161  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2420  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.43 
 
 
184 aa  161  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5402  mutT/nudix family protein  45.9 
 
 
188 aa  161  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4941  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.45 
 
 
188 aa  161  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3080  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.69 
 
 
187 aa  159  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0014  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.14 
 
 
181 aa  157  7e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0524  ADP-ribose diphosphatase NudE  43.89 
 
 
192 aa  154  9e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2661  ADP-ribose diphosphatase NudE  44.15 
 
 
211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283798  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1756  ADP-ribose diphosphatase NudE  43.26 
 
 
183 aa  137  6e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  31.95 
 
 
183 aa  89.4  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 
175 aa  87.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  30.72 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  30.72 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 
195 aa  84  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  30.99 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
187 aa  80.9  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  35 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  33.15 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  30.68 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  31.84 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  32.7 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  27.33 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  29.78 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  29.78 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  31.28 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
178 aa  70.9  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  28.36 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  26.52 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>