287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1756 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1756  ADP-ribose diphosphatase NudE  100 
 
 		 183 aa  374  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0331  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.02 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4068  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.59 
 
 		 185 aa  170  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0524  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.9 
 
 		 192 aa  170  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0117  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.93 
 
 		 195 aa  170  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2931  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.88 
 
 		 180 aa  168  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3890  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.33 
 
 		 185 aa  167  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001880  ADP compounds hydrolase NudE  47.22 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00613  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.7 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0183  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.51 
 
 		 183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0224  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.82 
 
 		 184 aa  164  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0252  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.76 
 
 		 190 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03249  ADP-ribose diphosphatase  45.05 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0316  NUDIX hydrolase  45.05 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3774  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.05 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3549  ADP-ribose diphosphatase NudE  44.69 
 
 		 183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0316  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.05 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155326 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03201  hypothetical protein  45.05 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3868  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.05 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3592  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.05 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3674  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.05 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.251567  normal  0.322169 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0119  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.73 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00596251  normal  0.391787 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4702  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.05 
 
 		 186 aa  162  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.631094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0129  ADP-ribose diphosphatase NudE  44.89 
 
 		 181 aa  162  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4612  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.49 
 
 		 184 aa  162  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4188  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.25 
 
 		 183 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0167  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.51 
 
 		 193 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03971  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.93 
 
 		 187 aa  161  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.222226  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0171  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.51 
 
 		 183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0424  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.09 
 
 		 183 aa  161  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3810  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.05 
 
 		 186 aa  160  7e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  44.13 
 
 		 183 aa  160  7e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  44.13 
 
 		 183 aa  160  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00239764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4346  ADP-ribose diphosphatase NudE  44.13 
 
 		 181 aa  160  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0164  ADP-ribose diphosphatase NudE  44.13 
 
 		 183 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2294  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.86 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3800  ADP-ribose diphosphatase NudE  44.51 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3863  ADP-ribose diphosphatase NudE  44.51 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3766  ADP-ribose diphosphatase NudE  44.51 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3691  ADP-ribose diphosphatase NudE  44.51 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3693  ADP-ribose diphosphatase NudE  44.51 
 
 		 187 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4718  ADP-ribose diphosphatase NudE  43.58 
 
 		 181 aa  158  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0156  ADP-ribose diphosphatase NudE  43.89 
 
 		 184 aa  157  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00016487  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2913  ADP-ribose diphosphatase NudE  44.75 
 
 		 183 aa  156  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0370  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.2 
 
 		 199 aa  155  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174333 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3623  ADP-ribose diphosphatase NudE  44.07 
 
 		 182 aa  154  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2420  ADP-ribose diphosphatase NudE  43.02 
 
 		 184 aa  154  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0180  ADP-ribose diphosphatase NudE  44.2 
 
 		 181 aa  154  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3734  ADP-ribose diphosphatase NudE  44.2 
 
 		 181 aa  154  9e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3973  ADP-ribose diphosphatase NudE  44.2 
 
 		 181 aa  154  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0190  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.25 
 
 		 183 aa  153  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2059  ADP-ribose diphosphatase NudE  44.32 
 
 		 196 aa  152  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3080  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.45 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1467  ADP-ribose diphosphatase NudE  41.01 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.858308  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0014  ADP-ribose diphosphatase NudE  42.11 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01648  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.3 
 
 		 182 aa  142  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.541498  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2418  NUDIX hydrolase  40.45 
 
 		 181 aa  141  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0160  ADP-ribose diphosphatase NudE  40 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0141  ADP-ribose diphosphatase NudE  40 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2275  ADP-ribose diphosphatase NudE  43.82 
 
 		 186 aa  138  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4950  ADP-ribose diphosphatase NudE  40.98 
 
 		 188 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  hitchhiker  0.0000179344 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2302  ADP-ribose diphosphatase NudE  43.26 
 
 		 186 aa  137  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0138  ADP-ribose diphosphatase NudE  40.22 
 
 		 187 aa  137  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0275  ADP-ribose diphosphatase NudE  40 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0260  ADP-ribose diphosphatase NudE  40 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0135852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0285  ADP-ribose diphosphatase NudE  40 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0284  ADP-ribose diphosphatase NudE  39.89 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304837 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5402  mutT/nudix family protein  42.08 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0393  ADP-ribose diphosphatase NudE  38.8 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2661  ADP-ribose diphosphatase NudE  42.31 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283798  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05490  ADP-ribose diphosphatase NudE  38.25 
 
 		 188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00271926  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4941  ADP-ribose diphosphatase NudE  41.53 
 
 		 188 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68380  ADP-ribose diphosphatase NudE  37.7 
 
 		 188 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000374463  normal  0.555558 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5916  ADP-ribose diphosphatase NudE  37.7 
 
 		 188 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1402  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173305  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  26.74 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0092  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  33.81 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0603  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0913378  normal  0.29293 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  24.68 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  28.05 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  27.07 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 187 aa  62  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1592  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0010  MutT/nudix family protein  26.14 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  27.27 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3582  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  26.06 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  26.06 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  26.06 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  26.06 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>