More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0010 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0010  MutT/nudix family protein  100 
 
 
188 aa  387  1e-107  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0673  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
191 aa  99.4  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5882  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 
191 aa  94  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0039  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 
183 aa  94.4  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3605  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 
181 aa  92.8  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  33.73 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  34.66 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  31.95 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1344  hypothetical protein  36.96 
 
 
265 aa  77.8  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.321071  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1402  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 
181 aa  77  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173305  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  31.95 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 
184 aa  77.8  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  32.45 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  31.95 
 
 
179 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  31.95 
 
 
179 aa  77  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  31.95 
 
 
179 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  31.95 
 
 
179 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  31.95 
 
 
179 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  34.09 
 
 
176 aa  77  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  31.95 
 
 
179 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  29.61 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6545  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  29.11 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  31.55 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  29.53 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3899  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3069  NUDIX hydrolase  29.28 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1544  NUDIX hydrolase  31.64 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  29.88 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5000  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0119  ADP-ribose diphosphatase NudE  27.81 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00596251  normal  0.391787 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  28.26 
 
 
176 aa  67.8  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  25.71 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0424  ADP-ribose diphosphatase NudE  27.33 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0331  ADP-ribose diphosphatase NudE  28.99 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0603  NUDIX hydrolase  27.21 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0913378  normal  0.29293 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  26.21 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  28.22 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  32.21 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001880  ADP compounds hydrolase NudE  30.59 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1677  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.855535  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2302  ADP-ribose diphosphatase NudE  29.52 
 
 
186 aa  63.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2275  ADP-ribose diphosphatase NudE  29.52 
 
 
186 aa  63.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3513  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 
184 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.200164 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0138  ADP-ribose diphosphatase NudE  28.41 
 
 
187 aa  63.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 
184 aa  64.3  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 
164 aa  64.3  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00613  ADP-ribose diphosphatase NudE  30.06 
 
 
188 aa  63.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  28.82 
 
 
194 aa  63.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3582  NUDIX hydrolase  27.44 
 
 
205 aa  62.8  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  27.7 
 
 
178 aa  62.8  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 
187 aa  62.8  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1592  NUDIX hydrolase  29.49 
 
 
201 aa  62  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
204 aa  62.4  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  32.56 
 
 
194 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2294  ADP-ribose diphosphatase NudE  28.18 
 
 
204 aa  62.4  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  22.81 
 
 
171 aa  62  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3890  ADP-ribose diphosphatase NudE  26.79 
 
 
185 aa  62  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  27.81 
 
 
201 aa  62  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1495  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 
182 aa  62  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.403846  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  28.4 
 
 
211 aa  62  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0982  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 
177 aa  61.6  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76015  normal  0.0931916 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 
281 aa  61.6  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1756  ADP-ribose diphosphatase NudE  26.14 
 
 
183 aa  61.6  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  27.46 
 
 
173 aa  61.6  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  25.58 
 
 
183 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  25.58 
 
 
183 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00239764  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 
186 aa  61.6  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
179 aa  61.6  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0252  ADP-ribose diphosphatase NudE  27.81 
 
 
190 aa  61.6  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  28.67 
 
 
187 aa  61.6  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  31.13 
 
 
194 aa  61.2  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3354  mutT/nudix family protein  31.37 
 
 
173 aa  61.2  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  29.7 
 
 
180 aa  61.2  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4612  ADP-ribose diphosphatase NudE  28.14 
 
 
184 aa  61.2  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2637  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
217 aa  61.2  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4718  ADP-ribose diphosphatase NudE  31.11 
 
 
181 aa  60.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  27.33 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4068  ADP-ribose diphosphatase NudE  26.79 
 
 
185 aa  60.5  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2931  ADP-ribose diphosphatase NudE  25.14 
 
 
180 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  25 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0164  ADP-ribose diphosphatase NudE  25.58 
 
 
183 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  26.47 
 
 
173 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2913  ADP-ribose diphosphatase NudE  28.14 
 
 
183 aa  59.7  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3623  ADP-ribose diphosphatase NudE  27.43 
 
 
182 aa  60.1  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>