More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0285 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0285  ADP-ribose diphosphatase NudE  100 
 
 		 188 aa  373  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0260  ADP-ribose diphosphatase NudE  98.94 
 
 		 188 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0135852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0275  ADP-ribose diphosphatase NudE  98.94 
 
 		 188 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4950  ADP-ribose diphosphatase NudE  97.34 
 
 		 188 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  hitchhiker  0.0000179344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0284  ADP-ribose diphosphatase NudE  87.7 
 
 		 188 aa  332  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0393  ADP-ribose diphosphatase NudE  84.24 
 
 		 188 aa  317  5e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5916  ADP-ribose diphosphatase NudE  82.61 
 
 		 188 aa  312  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68380  ADP-ribose diphosphatase NudE  82.61 
 
 		 188 aa  312  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000374463  normal  0.555558 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05490  ADP-ribose diphosphatase NudE  79.26 
 
 		 188 aa  305  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00271926  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4941  ADP-ribose diphosphatase NudE  83.42 
 
 		 188 aa  298  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5402  mutT/nudix family protein  82.89 
 
 		 188 aa  294  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2661  ADP-ribose diphosphatase NudE  57.54 
 
 		 211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283798  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0156  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.37 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00016487  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2931  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.89 
 
 		 180 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.07 
 
 		 183 aa  184  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.07 
 
 		 183 aa  184  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00239764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0164  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.07 
 
 		 183 aa  184  7e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1467  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.14 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.858308  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0129  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.69 
 
 		 181 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0167  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.07 
 
 		 193 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4188  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.07 
 
 		 183 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0171  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.07 
 
 		 183 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4346  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.12 
 
 		 181 aa  180  9.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0117  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.4 
 
 		 195 aa  179  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3691  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.2 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4718  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.71 
 
 		 181 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3863  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.2 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3693  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.2 
 
 		 187 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3766  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.2 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3800  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.2 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3549  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.4 
 
 		 183 aa  178  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0183  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.07 
 
 		 183 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3810  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.09 
 
 		 186 aa  177  9e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4702  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.1 
 
 		 186 aa  176  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.631094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0224  ADP-ribose diphosphatase NudE  50 
 
 		 184 aa  177  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0370  ADP-ribose diphosphatase NudE  54.1 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174333 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3674  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.09 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.251567  normal  0.322169 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03249  ADP-ribose diphosphatase  51.1 
 
 		 186 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0316  NUDIX hydrolase  51.1 
 
 		 186 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3592  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.1 
 
 		 186 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03201  hypothetical protein  51.1 
 
 		 186 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3774  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.1 
 
 		 186 aa  176  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3868  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.1 
 
 		 186 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0316  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.1 
 
 		 186 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155326 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0190  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.07 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0252  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.18 
 
 		 190 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3890  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.12 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0331  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.12 
 
 		 184 aa  171  5.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03971  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.14 
 
 		 187 aa  171  7.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.222226  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3623  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.27 
 
 		 182 aa  170  9e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2302  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.99 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2275  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.45 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0424  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.93 
 
 		 183 aa  168  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2420  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.28 
 
 		 184 aa  168  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4612  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.44 
 
 		 184 aa  168  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2913  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.28 
 
 		 183 aa  167  8e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4068  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.75 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2294  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.58 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0119  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.51 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00596251  normal  0.391787 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2418  NUDIX hydrolase  48.04 
 
 		 181 aa  164  8e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2059  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.4 
 
 		 196 aa  164  8e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001880  ADP compounds hydrolase NudE  49.14 
 
 		 189 aa  164  9e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00613  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.14 
 
 		 188 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3973  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.33 
 
 		 181 aa  161  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0180  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.33 
 
 		 181 aa  161  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3734  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.33 
 
 		 181 aa  161  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0138  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.45 
 
 		 187 aa  160  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0524  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.88 
 
 		 192 aa  157  8e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01648  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.23 
 
 		 182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.541498  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3080  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.62 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0160  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.49 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0141  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.49 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0014  ADP-ribose diphosphatase NudE  41.57 
 
 		 181 aa  148  5e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1756  ADP-ribose diphosphatase NudE  40 
 
 		 183 aa  133  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  27.11 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  27.11 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  26.4 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  25 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  26.83 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  31.32 
 
 		 183 aa  72  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  28.96 
 
 		 195 aa  72  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 		 179 aa  72  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  36.49 
 
 		 281 aa  71.6  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  27.54 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  26.01 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  26.9 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  27.66 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  26.29 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  32.34 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  32.85 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  23.7 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1768  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00835912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>