More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0252 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0252  ADP-ribose diphosphatase NudE  100 
 
 
190 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0331  ADP-ribose diphosphatase NudE  87.36 
 
 
184 aa  328  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3890  ADP-ribose diphosphatase NudE  84.44 
 
 
185 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4068  ADP-ribose diphosphatase NudE  81.11 
 
 
185 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4612  ADP-ribose diphosphatase NudE  82.78 
 
 
184 aa  305  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0180  ADP-ribose diphosphatase NudE  80.45 
 
 
181 aa  295  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3734  ADP-ribose diphosphatase NudE  80.45 
 
 
181 aa  295  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3973  ADP-ribose diphosphatase NudE  80.45 
 
 
181 aa  295  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3691  ADP-ribose diphosphatase NudE  74.32 
 
 
198 aa  281  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3863  ADP-ribose diphosphatase NudE  74.32 
 
 
198 aa  281  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3766  ADP-ribose diphosphatase NudE  74.32 
 
 
198 aa  281  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3800  ADP-ribose diphosphatase NudE  74.32 
 
 
198 aa  281  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3693  ADP-ribose diphosphatase NudE  74.32 
 
 
187 aa  280  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4702  ADP-ribose diphosphatase NudE  73.77 
 
 
186 aa  278  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.631094  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03249  ADP-ribose diphosphatase  73.22 
 
 
186 aa  277  6e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0316  NUDIX hydrolase  73.22 
 
 
186 aa  277  6e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03201  hypothetical protein  73.22 
 
 
186 aa  277  6e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3592  ADP-ribose diphosphatase NudE  73.22 
 
 
186 aa  277  6e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0316  ADP-ribose diphosphatase NudE  73.22 
 
 
186 aa  277  6e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.155326 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3774  ADP-ribose diphosphatase NudE  73.22 
 
 
186 aa  277  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3868  ADP-ribose diphosphatase NudE  73.22 
 
 
186 aa  277  6e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3674  ADP-ribose diphosphatase NudE  73.22 
 
 
186 aa  277  7e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.251567  normal  0.322169 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3810  ADP-ribose diphosphatase NudE  73.22 
 
 
186 aa  277  7e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0014  ADP-ribose diphosphatase NudE  65 
 
 
181 aa  244  6e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2913  ADP-ribose diphosphatase NudE  64.44 
 
 
183 aa  228  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001880  ADP compounds hydrolase NudE  61.14 
 
 
189 aa  221  6e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2294  ADP-ribose diphosphatase NudE  60.92 
 
 
204 aa  221  6e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0129  ADP-ribose diphosphatase NudE  61.71 
 
 
181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0224  ADP-ribose diphosphatase NudE  57.3 
 
 
184 aa  218  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00613  ADP-ribose diphosphatase NudE  60.57 
 
 
188 aa  218  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0117  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.89 
 
 
195 aa  218  6e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.89 
 
 
183 aa  216  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.89 
 
 
183 aa  216  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00239764  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0183  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.89 
 
 
183 aa  216  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0167  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.89 
 
 
193 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0171  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.89 
 
 
183 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4188  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.89 
 
 
183 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0164  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.33 
 
 
183 aa  215  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3549  ADP-ribose diphosphatase NudE  56.11 
 
 
183 aa  209  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0156  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.56 
 
 
184 aa  208  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00016487  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0190  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.89 
 
 
183 aa  206  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0138  ADP-ribose diphosphatase NudE  55.43 
 
 
187 aa  205  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4718  ADP-ribose diphosphatase NudE  55.8 
 
 
181 aa  201  7e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4346  ADP-ribose diphosphatase NudE  56.25 
 
 
181 aa  200  8e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03971  ADP-ribose diphosphatase NudE  54.89 
 
 
187 aa  200  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.222226  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0424  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.3 
 
 
183 aa  197  6e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0119  ADP-ribose diphosphatase NudE  55.88 
 
 
185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00596251  normal  0.391787 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2931  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.27 
 
 
180 aa  191  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3623  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.87 
 
 
182 aa  187  8e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2302  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.72 
 
 
186 aa  186  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2275  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.72 
 
 
186 aa  186  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2059  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.98 
 
 
196 aa  185  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2420  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.41 
 
 
184 aa  185  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0524  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.72 
 
 
192 aa  180  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2418  NUDIX hydrolase  49.43 
 
 
181 aa  174  7e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0260  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.18 
 
 
188 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0135852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0275  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.18 
 
 
188 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4950  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.18 
 
 
188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  hitchhiker  0.0000179344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0285  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.18 
 
 
188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3080  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.88 
 
 
187 aa  169  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05490  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.51 
 
 
188 aa  168  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00271926  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1467  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.4 
 
 
187 aa  168  4e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.858308  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0370  ADP-ribose diphosphatase NudE  50 
 
 
199 aa  168  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.174333 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2661  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.35 
 
 
211 aa  167  8e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01648  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.19 
 
 
182 aa  166  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.541498  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0284  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.77 
 
 
188 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.304837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0393  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.96 
 
 
188 aa  165  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1756  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.76 
 
 
183 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5916  ADP-ribose diphosphatase NudE  44.2 
 
 
188 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68380  ADP-ribose diphosphatase NudE  44.2 
 
 
188 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000374463  normal  0.555558 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0141  ADP-ribose diphosphatase NudE  44.02 
 
 
182 aa  158  4e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5402  mutT/nudix family protein  48.65 
 
 
188 aa  158  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0160  ADP-ribose diphosphatase NudE  44.02 
 
 
182 aa  157  8e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4941  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.57 
 
 
188 aa  154  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 
178 aa  79  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 
187 aa  79  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  29.14 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 
164 aa  73.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  28.26 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  27.13 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  29.87 
 
 
182 aa  72  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  31.14 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  26.9 
 
 
175 aa  71.2  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  26.62 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  26.11 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  28 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  29.87 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5882  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>