More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3558 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 173 aa  350  5e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  98.84 
 
 		 173 aa  346  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  68.82 
 
 		 173 aa  248  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  66.27 
 
 		 173 aa  241  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3354  mutT/nudix family protein  67.86 
 
 		 173 aa  229  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  40.96 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  43.93 
 
 		 179 aa  138  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  37.87 
 
 		 182 aa  136  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  42.51 
 
 		 172 aa  134  8e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  41.76 
 
 		 180 aa  132  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  38.65 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 		 176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 		 178 aa  124  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 		 186 aa  123  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  44.79 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 183 aa  122  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  41.57 
 
 		 186 aa  121  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  41.33 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  46.38 
 
 		 164 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 		 180 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  39.63 
 
 		 175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  42.14 
 
 		 171 aa  117  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  40.71 
 
 		 214 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  39.38 
 
 		 281 aa  117  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  35.15 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  34.73 
 
 		 178 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 177 aa  111  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 189 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  41.89 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 		 177 aa  108  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 		 192 aa  107  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  45.65 
 
 		 164 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  34.97 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  42.96 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  36.59 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  34.97 
 
 		 179 aa  104  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  34.97 
 
 		 179 aa  104  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  34.97 
 
 		 179 aa  104  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  34.97 
 
 		 179 aa  104  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  34.97 
 
 		 179 aa  104  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  34.97 
 
 		 179 aa  104  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  34.97 
 
 		 179 aa  104  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  39.85 
 
 		 169 aa  104  6e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  37.95 
 
 		 180 aa  104  7e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 		 196 aa  104  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0212  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 186 aa  104  8e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.465676  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  34.36 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  34.09 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  34.36 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.98 
 
 		 196 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.98 
 
 		 196 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.04 
 
 		 196 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  42.22 
 
 		 169 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.98 
 
 		 196 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  35.98 
 
 		 196 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  35.98 
 
 		 196 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.98 
 
 		 196 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  33.94 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 189 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.37 
 
 		 196 aa  101  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 179 aa  100  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  39.1 
 
 		 176 aa  100  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 		 186 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 		 179 aa  100  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 211 aa  100  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 		 178 aa  100  9e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  38.31 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 187 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 187 aa  99.8  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 		 187 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  30.95 
 
 		 185 aa  98.6  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 184 aa  98.6  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  41.27 
 
 		 182 aa  98.6  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 		 196 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 		 196 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 215 aa  98.2  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 		 196 aa  98.2  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 201 aa  97.8  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  39.13 
 
 		 210 aa  97.8  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 		 195 aa  97.8  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  35.09 
 
 		 183 aa  97.4  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 		 175 aa  97.4  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0830  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.66661  normal  0.255619 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 		 196 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 		 196 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  34.66 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  34.18 
 
 		 207 aa  95.5  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>