More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3049 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  100 
 
 
182 aa  374  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  90.11 
 
 
182 aa  341  4e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  37.43 
 
 
201 aa  123  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  35.36 
 
 
184 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  37.57 
 
 
192 aa  121  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3753  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.641661  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
180 aa  114  8.999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 
177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 
181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
164 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
180 aa  108  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  37.43 
 
 
171 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  31.98 
 
 
182 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  34.88 
 
 
189 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 
178 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 
179 aa  99  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 
281 aa  98.6  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  37.95 
 
 
204 aa  98.2  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 
177 aa  98.2  6e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  32 
 
 
184 aa  97.4  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 
176 aa  97.4  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 
180 aa  97.1  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  34.1 
 
 
184 aa  94.7  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
178 aa  94.4  8e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 
186 aa  94  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
189 aa  94  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 
180 aa  94  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  32.54 
 
 
176 aa  92.8  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  31.55 
 
 
179 aa  93.2  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 
211 aa  92.8  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 
179 aa  92.4  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  35.15 
 
 
190 aa  92.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 
183 aa  92  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  30.29 
 
 
176 aa  92  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 
186 aa  91.7  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 
176 aa  90.9  8e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  29.48 
 
 
182 aa  90.5  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 
199 aa  89.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
199 aa  89  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  31.33 
 
 
176 aa  87.8  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
183 aa  87.8  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  33.73 
 
 
205 aa  87  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 
179 aa  87  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  29.83 
 
 
184 aa  86.3  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  30.59 
 
 
183 aa  86.3  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  30.54 
 
 
172 aa  85.9  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  34.73 
 
 
180 aa  85.9  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  28.4 
 
 
175 aa  85.5  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
199 aa  84.7  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
184 aa  84.7  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 
179 aa  84.3  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
192 aa  84  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  30.11 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
180 aa  82  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2467  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3899  NUDIX hydrolase  31.07 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  29.55 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 
179 aa  80.9  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  26.63 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
171 aa  80.9  0.000000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  29.21 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000782  ADP-ribose pyrophosphatase  29.07 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2672  NUDIX hydrolase  31.14 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687973  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0119  ADP-ribose diphosphatase NudE  32.85 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00596251  normal  0.391787 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  29.55 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  29.55 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  29.55 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  29.55 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3623  ADP-ribose diphosphatase NudE  26.4 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1489  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2018  NUDIX hydrolase  35.75 
 
 
192 aa  79  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  29.55 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  29.55 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  26.04 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0227  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.282406  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  29.05 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  35.88 
 
 
181 aa  77.4  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  28.98 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0212  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.465676  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1523  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0341  NUDIX hydrolase  30.29 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  30.68 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1755  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106102  hitchhiker  0.000762275 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  28.16 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>