More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0219 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 184 aa  374  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  65.56 
 
 		 189 aa  247  8e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  64.74 
 
 		 184 aa  244  4.9999999999999997e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  55.17 
 
 		 184 aa  203  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  51.96 
 
 		 192 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  53.85 
 
 		 201 aa  193  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 201 aa  184  7e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  49.71 
 
 		 182 aa  181  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  51.41 
 
 		 189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3753  NUDIX hydrolase  43.96 
 
 		 206 aa  168  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.641661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 180 aa  119  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  37.2 
 
 		 184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  36.65 
 
 		 180 aa  108  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4021  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4251  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4096  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  34.66 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  39.39 
 
 		 181 aa  101  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02241  hypothetical protein  37.13 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0727099  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  34.32 
 
 		 183 aa  97.8  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  34.5 
 
 		 182 aa  97.8  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 176 aa  97.4  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  32.34 
 
 		 192 aa  95.1  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  34.1 
 
 		 182 aa  94.7  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 		 177 aa  94.4  8e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2018  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 		 192 aa  93.6  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  35.39 
 
 		 209 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6125  NUDIX hydrolase  36.16 
 
 		 178 aa  92.8  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000782  ADP-ribose pyrophosphatase  34.94 
 
 		 179 aa  93.2  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3065  hypothetical protein  34.88 
 
 		 181 aa  92  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194764 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  31.84 
 
 		 215 aa  92  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6067  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 193 aa  91.7  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 182 aa  92  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 213 aa  91.3  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 180 aa  90.9  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 		 173 aa  90.9  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29440  NUDIX family protein  35.54 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 173 aa  89.4  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  31.05 
 
 		 210 aa  88.6  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2006  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 186 aa  88.2  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00276085  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  31.98 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1523  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 180 aa  87.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 180 aa  87  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0978  NUDIX hydrolase  29.7 
 
 		 189 aa  85.9  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  28.25 
 
 		 215 aa  85.9  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 173 aa  85.5  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  28.96 
 
 		 199 aa  85.9  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  29.73 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2174  NUDIX hydrolase  32.34 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0334323  normal  0.0698698 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4523  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2192  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4016  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.298866 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  34.03 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4737  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1489  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  29.7 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  31.1 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  31.1 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  32.72 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  26.83 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3140  NUDIX hydrolase  33.55 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511935  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0740  NTP pyrophosphohydrolase including oxidative damage repair enzyme  31.95 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000988568  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  30.73 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  28.02 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  30.49 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  28.92 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  28.92 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  27.87 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  28.27 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  32.94 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0185  hypothetical protein  31.33 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.533354  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  31.71 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0341  NUDIX hydrolase  27.43 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.01 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>