More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0740 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0740  NTP pyrophosphohydrolase including oxidative damage repair enzyme  100 
 
 
199 aa  416  9.999999999999999e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000988568  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 
177 aa  90.5  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  36.5 
 
 
179 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 
176 aa  85.1  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 
164 aa  84.7  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0524  ADP-ribose diphosphatase NudE  32.95 
 
 
192 aa  84  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  35.77 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  35.77 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  35.77 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  35.77 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  35.77 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  35.77 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1134  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  35.77 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  35.04 
 
 
179 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 
178 aa  79  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 
179 aa  79  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
281 aa  77.4  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 
173 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  31.64 
 
 
184 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0185  hypothetical protein  36.29 
 
 
335 aa  75.9  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.533354  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  31.95 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1336  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.723792 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  33.79 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  33.72 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  33.59 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  34.03 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  33.76 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  32.54 
 
 
214 aa  72  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 
173 aa  72  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 
173 aa  72  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3069  NUDIX hydrolase  28.25 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
215 aa  71.2  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  34.46 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 
211 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  28.26 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00613  ADP-ribose diphosphatase NudE  26.2 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  36.64 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  31.75 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1886  NUDIX hydrolase  34.42 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.556059 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  27.06 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  29.5 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
173 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  29.86 
 
 
192 aa  67.8  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001880  ADP compounds hydrolase NudE  26.29 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  27.37 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  27.71 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  29.24 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  30.15 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0268  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.880251  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  29.12 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1344  hypothetical protein  29.03 
 
 
265 aa  65.1  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.321071  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  28.07 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0227  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.282406  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  30.29 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  31.84 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2913  ADP-ribose diphosphatase NudE  27.65 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000782  ADP-ribose pyrophosphatase  33.08 
 
 
179 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  33.08 
 
 
171 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0830  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
177 aa  64.3  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.66661  normal  0.255619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 
201 aa  63.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 
186 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  27.5 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  30.12 
 
 
187 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>