271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000782 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000782  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 
179 aa  375  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3065  hypothetical protein  61.45 
 
 
181 aa  241  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194764 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1523  NUDIX hydrolase  59.32 
 
 
180 aa  227  7e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6067  NUDIX hydrolase  53.93 
 
 
193 aa  215  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114891  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02241  hypothetical protein  57.54 
 
 
179 aa  213  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0727099  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  50.56 
 
 
180 aa  190  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4737  NUDIX hydrolase  48.55 
 
 
174 aa  177  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4021  NUDIX hydrolase  43.58 
 
 
181 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4096  NUDIX hydrolase  43.58 
 
 
181 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196207  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4251  NUDIX hydrolase  43.58 
 
 
181 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2006  NUDIX hydrolase  44.97 
 
 
186 aa  159  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00276085  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4797  NUDIX hydrolase  44.24 
 
 
196 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868054  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29440  NUDIX family protein  44.19 
 
 
179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2174  NUDIX hydrolase  40.7 
 
 
190 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0334323  normal  0.0698698 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4523  NUDIX hydrolase  43.98 
 
 
178 aa  145  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2018  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 
192 aa  142  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6125  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 
178 aa  141  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4016  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 
183 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.298866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1489  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
173 aa  123  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3458  NUDIX hydrolase  40.49 
 
 
215 aa  122  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  36.93 
 
 
180 aa  108  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  37.29 
 
 
192 aa  107  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 
184 aa  105  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 
180 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  39.41 
 
 
181 aa  99.4  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
179 aa  99.4  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 
201 aa  95.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 
176 aa  94.7  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 
184 aa  93.2  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 
184 aa  92  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 
184 aa  89.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  32.74 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
177 aa  89  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  34.3 
 
 
184 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  32.16 
 
 
178 aa  87.4  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 
281 aa  85.1  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  31.64 
 
 
215 aa  85.1  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  34.16 
 
 
177 aa  85.1  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  31.95 
 
 
177 aa  84.3  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 
199 aa  84.3  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
189 aa  84.3  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  30.43 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 
178 aa  82  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0978  NUDIX hydrolase  27.98 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 
201 aa  82  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  31.21 
 
 
214 aa  82  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  29.76 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 
189 aa  81.3  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2192  NUDIX hydrolase  34.5 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349846  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  32.72 
 
 
179 aa  80.9  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  29.07 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  31.21 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  28.82 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  31.61 
 
 
213 aa  78.2  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  29.09 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  28.98 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  29.24 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  30.86 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  30.86 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  30.86 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  30.86 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  33.59 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  30.86 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  30.86 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  31.61 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  27.71 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3753  NUDIX hydrolase  32.1 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.641661  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  30.86 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  30.59 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  29.24 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  29.17 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  30.94 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  29.48 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  30.46 
 
 
189 aa  74.3  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  30.29 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  30.64 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  29.71 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  31.79 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  29.07 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  27.98 
 
 
183 aa  72  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  31.55 
 
 
175 aa  72  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0603  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0913378  normal  0.29293 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  28.4 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>