More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6125 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6125  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 178 aa  363  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4251  NUDIX hydrolase  73.68 
 
 		 181 aa  254  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4021  NUDIX hydrolase  73.68 
 
 		 181 aa  254  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4096  NUDIX hydrolase  73.68 
 
 		 181 aa  254  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29440  NUDIX family protein  75.29 
 
 		 179 aa  250  7e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2174  NUDIX hydrolase  68.57 
 
 		 190 aa  247  6e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0334323  normal  0.0698698 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4523  NUDIX hydrolase  68.71 
 
 		 178 aa  227  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2006  NUDIX hydrolase  59.54 
 
 		 186 aa  201  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00276085  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1489  NUDIX hydrolase  54.6 
 
 		 173 aa  168  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6067  NUDIX hydrolase  49.42 
 
 		 193 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2018  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 		 192 aa  154  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3065  hypothetical protein  47.59 
 
 		 181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194764 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3458  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 215 aa  149  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1523  NUDIX hydrolase  43.79 
 
 		 180 aa  143  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4737  NUDIX hydrolase  45.93 
 
 		 174 aa  141  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000782  ADP-ribose pyrophosphatase  43.1 
 
 		 179 aa  141  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 		 180 aa  140  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4016  NUDIX hydrolase  49.4 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.298866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4797  NUDIX hydrolase  49.4 
 
 		 196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868054  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02241  hypothetical protein  41.62 
 
 		 179 aa  136  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0727099  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  40.59 
 
 		 192 aa  110  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 184 aa  104  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 201 aa  101  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  38.29 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 184 aa  98.6  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  39.43 
 
 		 209 aa  97.4  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  37.95 
 
 		 180 aa  97.1  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  38.86 
 
 		 209 aa  94.7  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  38.86 
 
 		 209 aa  94.7  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  36.16 
 
 		 184 aa  92.8  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  38.07 
 
 		 189 aa  92.8  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  37.28 
 
 		 215 aa  92.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 179 aa  91.7  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  35.47 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 		 189 aa  88.6  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 		 201 aa  88.6  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0978  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 		 189 aa  87.8  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 210 aa  87  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 211 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  34.73 
 
 		 215 aa  85.9  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  30.29 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2192  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  37.58 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 211 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 		 180 aa  80.9  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  35.1 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1755  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106102  hitchhiker  0.000762275 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  33.92 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1579  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.904804  normal  0.0162238 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  28.66 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  36.18 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  30.18 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  34.36 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  33.92 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  35.4 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0185  hypothetical protein  30.99 
 
 		 335 aa  71.6  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.533354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  36.42 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  28.82 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1200  hypothetical protein  37.59 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552549  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  28 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  31.74 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  38.97 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  32.21 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  33.79 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  27.43 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  38.97 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  30.07 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  37.01 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4431  NUDIX hydrolase  33.92 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>