286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29440 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_29440  NUDIX family protein  100 
 
 		 179 aa  362  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6125  NUDIX hydrolase  75.29 
 
 		 178 aa  263  7e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4021  NUDIX hydrolase  70.86 
 
 		 181 aa  257  8e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4251  NUDIX hydrolase  70.86 
 
 		 181 aa  257  8e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4096  NUDIX hydrolase  70.86 
 
 		 181 aa  257  8e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2174  NUDIX hydrolase  68.02 
 
 		 190 aa  240  7e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0334323  normal  0.0698698 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4523  NUDIX hydrolase  70.89 
 
 		 178 aa  231  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2006  NUDIX hydrolase  54.97 
 
 		 186 aa  184  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00276085  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6067  NUDIX hydrolase  52.41 
 
 		 193 aa  175  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1489  NUDIX hydrolase  51.53 
 
 		 173 aa  162  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2018  NUDIX hydrolase  47.95 
 
 		 192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3065  hypothetical protein  44.97 
 
 		 181 aa  151  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4016  NUDIX hydrolase  49.7 
 
 		 183 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.298866 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000782  ADP-ribose pyrophosphatase  44.19 
 
 		 179 aa  151  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3458  NUDIX hydrolase  45.29 
 
 		 215 aa  149  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  45.09 
 
 		 180 aa  142  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02241  hypothetical protein  39.53 
 
 		 179 aa  141  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0727099  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4797  NUDIX hydrolase  49.7 
 
 		 196 aa  141  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868054  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1523  NUDIX hydrolase  42.01 
 
 		 180 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4737  NUDIX hydrolase  43.6 
 
 		 174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  41.57 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  38.65 
 
 		 192 aa  99.8  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 184 aa  99  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  35.93 
 
 		 184 aa  99  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  37.28 
 
 		 215 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 		 180 aa  95.5  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  38.32 
 
 		 209 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  40.49 
 
 		 201 aa  92.4  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  34.5 
 
 		 201 aa  92  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  35.93 
 
 		 207 aa  91.7  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 		 209 aa  91.7  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 		 209 aa  91.7  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 179 aa  91.7  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 184 aa  87.8  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  37.57 
 
 		 189 aa  86.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  34.76 
 
 		 182 aa  84.3  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  38.01 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2192  NUDIX hydrolase  39.41 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0978  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  32.16 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  39.29 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  28.9 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  33.92 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  30.64 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 184 aa  77.4  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  33.95 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  28.65 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  34.71 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  30.95 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  32.16 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  28.16 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  28.65 
 
 		 175 aa  73.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  29.38 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0268  NUDIX hydrolase  27.22 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.880251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1579  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.904804  normal  0.0162238 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  29.76 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.32 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  30.92 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.34 
 
 		 196 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  31.14 
 
 		 194 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  31.1 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  31.74 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  31.14 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  26.59 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  31.1 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  32.1 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  30.54 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  31.14 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  31.14 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  31.74 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.74 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  31.74 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  27.59 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.74 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.74 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.74 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 210 aa  67.8  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>