294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2928 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 189 aa  388  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  65.56 
 
 		 184 aa  247  8e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  59.89 
 
 		 184 aa  224  4e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  54.12 
 
 		 184 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  49.21 
 
 		 201 aa  192  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  53.22 
 
 		 192 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 201 aa  185  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  49.71 
 
 		 182 aa  177  8e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3753  NUDIX hydrolase  47.28 
 
 		 206 aa  174  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.641661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  48.92 
 
 		 189 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  41.62 
 
 		 184 aa  134  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  40.61 
 
 		 180 aa  123  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  45.45 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  37.87 
 
 		 180 aa  112  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  34.5 
 
 		 180 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 		 177 aa  99.8  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  35.36 
 
 		 209 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  31.55 
 
 		 192 aa  97.1  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  35.36 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  35.36 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2192  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 		 183 aa  95.9  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2006  NUDIX hydrolase  35.12 
 
 		 186 aa  94.7  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00276085  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 215 aa  94.4  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4021  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 		 181 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4251  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 		 181 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4096  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 		 181 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 178 aa  91.3  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  32.6 
 
 		 180 aa  90.9  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3065  hypothetical protein  35.96 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194764 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6125  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 		 178 aa  88.6  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 173 aa  88.2  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1523  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 180 aa  86.3  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 		 173 aa  86.7  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 		 173 aa  85.9  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4737  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 174 aa  85.9  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 		 201 aa  85.1  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  29.88 
 
 		 180 aa  85.1  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  32.9 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  32.16 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4016  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.298866 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  31.1 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  33.95 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  33.95 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  32.72 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3458  NUDIX hydrolase  32.57 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2018  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000782  ADP-ribose pyrophosphatase  33.14 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 		 199 aa  80.9  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3140  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511935  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  32.42 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  37.07 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29440  NUDIX family protein  37.21 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  37.32 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  34.87 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  30.46 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4523  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  34.32 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2174  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0334323  normal  0.0698698 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1489  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  32.07 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02241  hypothetical protein  30.12 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0727099  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  32.1 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2153  NUDIX hydrolase  28.82 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0341  NUDIX hydrolase  25.29 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  28.74 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  31.76 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  33.79 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  32.35 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6545  NUDIX hydrolase  28.32 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 181 aa  72  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 		 183 aa  72  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  31.64 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  31.18 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  31.18 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>