More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0271 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 180 aa  374  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  46.51 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  42.53 
 
 		 184 aa  138  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  41.95 
 
 		 201 aa  130  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  41.42 
 
 		 184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  37.79 
 
 		 182 aa  119  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  43.2 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4251  NUDIX hydrolase  42.51 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4021  NUDIX hydrolase  42.51 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4096  NUDIX hydrolase  42.51 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  37.87 
 
 		 189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 184 aa  111  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 		 184 aa  111  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000782  ADP-ribose pyrophosphatase  36.93 
 
 		 179 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  37.28 
 
 		 201 aa  108  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6067  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 193 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  37.43 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3753  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.641661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2006  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00276085  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4016  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.298866 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  35.93 
 
 		 178 aa  101  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 177 aa  102  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2174  NUDIX hydrolase  37.95 
 
 		 190 aa  101  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0334323  normal  0.0698698 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2192  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3065  hypothetical protein  35.15 
 
 		 181 aa  99  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194764 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4737  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 		 174 aa  99  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 177 aa  97.8  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 		 281 aa  97.1  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6125  NUDIX hydrolase  37.95 
 
 		 178 aa  97.1  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 215 aa  97.1  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2018  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 		 192 aa  95.9  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02241  hypothetical protein  35.98 
 
 		 179 aa  95.1  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0727099  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1489  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 		 173 aa  95.1  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 177 aa  95.1  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 183 aa  95.1  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 		 180 aa  94.4  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 		 178 aa  94.4  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 180 aa  94  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 180 aa  93.2  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 		 181 aa  92.8  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4523  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 		 178 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 215 aa  92.4  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1544  NUDIX hydrolase  33.89 
 
 		 186 aa  92.4  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1523  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 180 aa  92.4  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  35.03 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 		 201 aa  92  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  33.14 
 
 		 210 aa  91.7  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  32.22 
 
 		 180 aa  90.9  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 201 aa  90.9  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 182 aa  90.9  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  35.17 
 
 		 173 aa  89.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  37.43 
 
 		 181 aa  89.4  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  32.75 
 
 		 181 aa  88.6  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 176 aa  88.6  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 211 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0978  NUDIX hydrolase  31.74 
 
 		 189 aa  87.8  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  32.72 
 
 		 190 aa  86.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  34.52 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 209 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 209 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  35.12 
 
 		 214 aa  86.3  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  35.15 
 
 		 164 aa  85.5  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  34.36 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 172 aa  85.5  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29440  NUDIX family protein  34.73 
 
 		 179 aa  85.5  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  30.43 
 
 		 176 aa  85.5  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 199 aa  84.7  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3458  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 215 aa  84.3  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1344  hypothetical protein  33.95 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.321071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0982  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76015  normal  0.0931916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0268  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.880251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  34.94 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  30.43 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  32 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  29.48 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  29.33 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  30.49 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4797  NUDIX hydrolase  34.32 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868054  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  30.72 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  30.72 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>