More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6067 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6067  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 193 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000782  ADP-ribose pyrophosphatase  53.93 
 
 		 179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3065  hypothetical protein  50.85 
 
 		 181 aa  202  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194764 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1523  NUDIX hydrolase  49.72 
 
 		 180 aa  190  9e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02241  hypothetical protein  50.85 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0727099  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 180 aa  179  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4021  NUDIX hydrolase  49.43 
 
 		 181 aa  171  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4251  NUDIX hydrolase  49.43 
 
 		 181 aa  171  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4096  NUDIX hydrolase  49.43 
 
 		 181 aa  171  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2018  NUDIX hydrolase  47.78 
 
 		 192 aa  165  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2006  NUDIX hydrolase  49.13 
 
 		 186 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00276085  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29440  NUDIX family protein  52.41 
 
 		 179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6125  NUDIX hydrolase  49.42 
 
 		 178 aa  164  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4737  NUDIX hydrolase  47.4 
 
 		 174 aa  161  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2174  NUDIX hydrolase  47.67 
 
 		 190 aa  160  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0334323  normal  0.0698698 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4523  NUDIX hydrolase  48.47 
 
 		 178 aa  155  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4797  NUDIX hydrolase  49.7 
 
 		 196 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868054  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4016  NUDIX hydrolase  45.93 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.298866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1489  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 173 aa  149  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3458  NUDIX hydrolase  43.03 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  37.13 
 
 		 192 aa  108  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 180 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 184 aa  102  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0978  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 189 aa  93.6  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 184 aa  91.7  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  30.57 
 
 		 215 aa  91.3  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 179 aa  88.2  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2192  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  35.15 
 
 		 180 aa  85.9  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  30.46 
 
 		 184 aa  84.3  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  32.72 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  28.31 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  28.32 
 
 		 180 aa  80.9  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  32.34 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  31.75 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.94 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.33 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.33 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  31.64 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.33 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  29.76 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.33 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.33 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  31.61 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  31.61 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  32.75 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  31.36 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  32.77 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  27.88 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  31.03 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  27.06 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  29.59 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  35.71 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  33.73 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  30.18 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0268  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.880251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 204 aa  72  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  31.95 
 
 		 178 aa  72  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 178 aa  72  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  31.66 
 
 		 203 aa  72  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3753  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.641661  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  31.91 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  31.95 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  35.15 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  29.89 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  31.46 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  29.89 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  29.89 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  29.89 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  29.89 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  27.22 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  29.89 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>