295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1523 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1523  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 180 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3065  hypothetical protein  67.8 
 
 		 181 aa  256  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194764 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02241  hypothetical protein  66.11 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0727099  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000782  ADP-ribose pyrophosphatase  59.32 
 
 		 179 aa  227  7e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  55.06 
 
 		 180 aa  201  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6067  NUDIX hydrolase  49.72 
 
 		 193 aa  190  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4737  NUDIX hydrolase  46.82 
 
 		 174 aa  168  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2018  NUDIX hydrolase  45.14 
 
 		 192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2006  NUDIX hydrolase  42.6 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00276085  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4797  NUDIX hydrolase  43.9 
 
 		 196 aa  147  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868054  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6125  NUDIX hydrolase  43.79 
 
 		 178 aa  143  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4251  NUDIX hydrolase  39.89 
 
 		 181 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4021  NUDIX hydrolase  39.89 
 
 		 181 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4096  NUDIX hydrolase  39.89 
 
 		 181 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29440  NUDIX family protein  42.01 
 
 		 179 aa  134  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4016  NUDIX hydrolase  39.01 
 
 		 183 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.298866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1489  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 173 aa  133  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2174  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0334323  normal  0.0698698 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4523  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 		 178 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3458  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 		 215 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  41.32 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 		 180 aa  99  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 		 184 aa  97.8  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 		 209 aa  97.8  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 		 209 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  35.98 
 
 		 176 aa  96.7  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 		 209 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  35.98 
 
 		 176 aa  95.9  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 		 178 aa  95.5  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 		 178 aa  94.7  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 		 180 aa  92.8  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  35.93 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 		 215 aa  92.4  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 180 aa  92.4  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 184 aa  91.7  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2192  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 		 211 aa  88.2  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 182 aa  88.6  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 		 281 aa  88.2  6e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 189 aa  86.3  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  33.92 
 
 		 177 aa  85.5  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 199 aa  85.5  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  33.73 
 
 		 210 aa  85.9  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  85.9  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  35.15 
 
 		 179 aa  85.1  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 201 aa  84.3  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  31.98 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  33.53 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  32.34 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  31.1 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  31.1 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  28.65 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  31.95 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  31.4 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  28.65 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  35.93 
 
 		 194 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  30.06 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0978  NUDIX hydrolase  30.54 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  31.98 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  30.05 
 
 		 214 aa  77.4  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  31.76 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  31.43 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  30.46 
 
 		 195 aa  74.3  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  30.36 
 
 		 171 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  28.92 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  28.31 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  29.38 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  28.92 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  29.31 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  31.55 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  31.55 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  31.55 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>