More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2826 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  100 
 
 		 192 aa  393  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  61.76 
 
 		 201 aa  233  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  59.41 
 
 		 184 aa  223  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  57.95 
 
 		 184 aa  216  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  57.65 
 
 		 189 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  51.96 
 
 		 184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  54.17 
 
 		 182 aa  191  8e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  53.22 
 
 		 189 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3753  NUDIX hydrolase  48.24 
 
 		 206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.641661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  45.81 
 
 		 201 aa  171  9e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  42.05 
 
 		 184 aa  148  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 		 180 aa  143  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  37.57 
 
 		 182 aa  121  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 		 182 aa  120  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 		 180 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4021  NUDIX hydrolase  40.72 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4251  NUDIX hydrolase  40.72 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4096  NUDIX hydrolase  40.72 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4737  NUDIX hydrolase  41.21 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  40.61 
 
 		 180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2174  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 190 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0334323  normal  0.0698698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6125  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 		 178 aa  110  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6067  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 		 193 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3065  hypothetical protein  38.18 
 
 		 181 aa  108  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194764 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 177 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4016  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 183 aa  108  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.298866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2006  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 186 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00276085  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000782  ADP-ribose pyrophosphatase  37.29 
 
 		 179 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  37.79 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 176 aa  105  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  40 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  35.15 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4523  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 		 178 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2192  NUDIX hydrolase  40.45 
 
 		 179 aa  102  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 209 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 209 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 164 aa  97.1  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1489  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 173 aa  95.1  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 		 177 aa  95.1  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29440  NUDIX family protein  36.75 
 
 		 179 aa  95.1  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 		 180 aa  94.7  7e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 		 179 aa  94  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 		 173 aa  93.2  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 192 aa  92.8  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 181 aa  92.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  33.89 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  36.65 
 
 		 173 aa  92.8  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0185  hypothetical protein  33.68 
 
 		 335 aa  92.4  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.533354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 180 aa  92.4  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  35.76 
 
 		 214 aa  92  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0978  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 189 aa  92.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 215 aa  91.3  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2018  NUDIX hydrolase  35.84 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  32.78 
 
 		 211 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  32.97 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  37.98 
 
 		 173 aa  89.4  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  35.47 
 
 		 194 aa  89  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  35.15 
 
 		 185 aa  89  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02241  hypothetical protein  32.72 
 
 		 179 aa  88.2  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0727099  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 		 171 aa  87.8  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0268  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 165 aa  85.5  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.880251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 186 aa  85.5  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4797  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 196 aa  84.7  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868054  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  31.87 
 
 		 207 aa  84.3  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1523  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 178 aa  84.3  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3458  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  31.84 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  30.12 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  37.98 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  33.95 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  33.53 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  33.79 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  29.78 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  34.16 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  30.81 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  31.36 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  33.54 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 		 281 aa  78.6  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  30.12 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  33.54 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  33.54 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  33.54 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>