More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2429 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 182 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  90.11 
 
 		 182 aa  341  4e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 184 aa  122  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  36.99 
 
 		 192 aa  120  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  35.75 
 
 		 201 aa  118  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3753  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 		 206 aa  118  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.641661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 		 181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  37.85 
 
 		 184 aa  111  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 177 aa  110  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 201 aa  110  9e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 184 aa  104  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  31.4 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  37.21 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 176 aa  101  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 		 180 aa  101  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  34.86 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 		 178 aa  99.8  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 		 281 aa  99  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 180 aa  98.2  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  34.5 
 
 		 184 aa  97.8  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 186 aa  97.8  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 179 aa  97.4  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 179 aa  95.9  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  30.29 
 
 		 176 aa  94.7  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 178 aa  93.2  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  33.95 
 
 		 184 aa  90.9  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 180 aa  90.9  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  29.48 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  30.54 
 
 		 172 aa  88.6  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 190 aa  87.8  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  29.76 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 		 176 aa  85.9  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2467  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 181 aa  85.9  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  33.92 
 
 		 183 aa  85.9  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 		 215 aa  85.1  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 199 aa  84.7  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  33.15 
 
 		 192 aa  84.7  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  34.34 
 
 		 205 aa  84.7  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  30.68 
 
 		 179 aa  84.7  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 173 aa  84.3  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 		 179 aa  84.3  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 171 aa  84.3  8e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  26.79 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2672  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687973  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  27.98 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  28.57 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  30.67 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  28.49 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  30.11 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  26.19 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1444  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.9766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  32.34 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  30.11 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  30.11 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  30.11 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  30.11 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  30.11 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  30.11 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  35.2 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1523  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  29.55 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0227  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.282406  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3069  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1221  NUDIX hydrolase  28.96 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3899  NUDIX hydrolase  30.64 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0212  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 186 aa  77.4  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.465676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  34.71 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>