More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0333 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  100 
 
 		 189 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  55.43 
 
 		 201 aa  211  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  57.65 
 
 		 192 aa  205  4e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  54.65 
 
 		 182 aa  204  7e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  52.27 
 
 		 184 aa  198  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  52.84 
 
 		 184 aa  194  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  48.92 
 
 		 189 aa  185  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  51.41 
 
 		 184 aa  184  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3753  NUDIX hydrolase  45.03 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.641661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 		 201 aa  141  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  43.2 
 
 		 180 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  41.52 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 		 182 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6125  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 		 178 aa  101  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 		 209 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2018  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 192 aa  95.9  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 		 178 aa  96.3  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 181 aa  95.5  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 		 209 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  41.73 
 
 		 173 aa  93.6  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 		 209 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  36.97 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2192  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4251  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 181 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4021  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 181 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4096  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 181 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  34.9 
 
 		 207 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 180 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4737  NUDIX hydrolase  36.16 
 
 		 174 aa  90.5  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  31.55 
 
 		 177 aa  90.5  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 215 aa  89.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  35.75 
 
 		 201 aa  88.6  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 		 177 aa  88.2  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3065  hypothetical protein  35.37 
 
 		 181 aa  87.8  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194764 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  30.18 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 199 aa  86.3  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4016  NUDIX hydrolase  38.15 
 
 		 183 aa  85.1  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.298866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 215 aa  84.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29440  NUDIX family protein  36.84 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1344  hypothetical protein  32.02 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.321071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1544  NUDIX hydrolase  29.05 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02241  hypothetical protein  31.9 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0727099  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6067  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  34.12 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  32.75 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 		 173 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000782  ADP-ribose pyrophosphatase  31.03 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2174  NUDIX hydrolase  33.95 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0334323  normal  0.0698698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  29.34 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  28.31 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2006  NUDIX hydrolase  35.93 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00276085  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3458  NUDIX hydrolase  31.46 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  33.95 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2153  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6545  NUDIX hydrolase  28.26 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  31.93 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  31.33 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  27.44 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4523  NUDIX hydrolase  36.2 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  28.31 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  33.16 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  33.54 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0341  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1489  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  31.33 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1579  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.904804  normal  0.0162238 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  32.57 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 		 175 aa  73.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  30.18 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0978  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>