More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0341 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0341  NUDIX hydrolase  100 
 
 
186 aa  366  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0703  putative ADP-ribose pyrophosphatase  77.05 
 
 
186 aa  299  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1278  NUDIX hydrolase  54.01 
 
 
185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  52.1 
 
 
181 aa  176  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4804  NUDIX hydrolase  47.65 
 
 
188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.483514 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14240  ADP-ribose pyrophosphatase  46.55 
 
 
182 aa  167  6e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4483  NUDIX hydrolase  47.65 
 
 
176 aa  152  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2153  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 
176 aa  151  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0896  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 
208 aa  151  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22169  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1579  NUDIX hydrolase  45.51 
 
 
172 aa  144  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.904804  normal  0.0162238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8603  transcriptional regulator, GntR family  29.34 
 
 
268 aa  97.8  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  0.233283 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1886  NUDIX hydrolase  35.5 
 
 
172 aa  87.4  9e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.556059 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 
176 aa  86.7  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  28.05 
 
 
169 aa  84  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  34.3 
 
 
184 aa  80.9  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  34.66 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  26.95 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 
177 aa  79  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  29.71 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0745  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
175 aa  77  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  28.74 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  31.32 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  30.29 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  30.29 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  28.48 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1336  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.723792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  25.29 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  27.43 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  29.44 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  27.5 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  30 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  30.64 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  34.27 
 
 
210 aa  72  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  27.43 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 
180 aa  70.9  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  30.38 
 
 
187 aa  70.9  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  35.03 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  23.64 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  34 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  25.53 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  28.48 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1200  hypothetical protein  37.8 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552549  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0830  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.66661  normal  0.255619 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 
181 aa  67.8  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  27.16 
 
 
185 aa  67  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  29.09 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 
178 aa  67  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  32.72 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  28.31 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  27.98 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  25.99 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  25.97 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  30.98 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  29.8 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  29.8 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  27.88 
 
 
171 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  25.9 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
281 aa  64.7  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  31.93 
 
 
171 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  31.3 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
208 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  27.54 
 
 
176 aa  62.4  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  27.22 
 
 
180 aa  62.4  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1402  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 
181 aa  61.6  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173305  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  26.79 
 
 
176 aa  61.6  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  27.88 
 
 
176 aa  61.2  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  29.34 
 
 
186 aa  61.6  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
176 aa  61.2  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0970  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
220 aa  61.6  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
213 aa  61.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  30.43 
 
 
179 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  30.43 
 
 
179 aa  60.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  30.43 
 
 
179 aa  60.8  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  30.43 
 
 
179 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  30.43 
 
 
179 aa  60.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  30.43 
 
 
179 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  30.43 
 
 
179 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 
210 aa  60.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
180 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  25.15 
 
 
176 aa  60.5  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2661  ADP-ribose diphosphatase NudE  30.66 
 
 
211 aa  60.5  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283798  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  28.05 
 
 
164 aa  60.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>