More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2661 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2661  ADP-ribose diphosphatase NudE  100 
 
 
211 aa  425  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283798  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5916  ADP-ribose diphosphatase NudE  59.78 
 
 
188 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68380  ADP-ribose diphosphatase NudE  59.78 
 
 
188 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000374463  normal  0.555558 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0393  ADP-ribose diphosphatase NudE  60.34 
 
 
188 aa  224  8e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05490  ADP-ribose diphosphatase NudE  60.89 
 
 
188 aa  223  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00271926  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4950  ADP-ribose diphosphatase NudE  59.22 
 
 
188 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  hitchhiker  0.0000179344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0260  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.66 
 
 
188 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0135852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0275  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.66 
 
 
188 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0284  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.66 
 
 
188 aa  218  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.304837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0285  ADP-ribose diphosphatase NudE  57.54 
 
 
188 aa  214  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4941  ADP-ribose diphosphatase NudE  60.89 
 
 
188 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5402  mutT/nudix family protein  60.34 
 
 
188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2931  ADP-ribose diphosphatase NudE  55.19 
 
 
180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0370  ADP-ribose diphosphatase NudE  55.56 
 
 
199 aa  184  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.174333 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0331  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.72 
 
 
184 aa  181  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0138  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.21 
 
 
187 aa  180  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03971  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.47 
 
 
187 aa  177  7e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.222226  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3890  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.72 
 
 
185 aa  176  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0119  ADP-ribose diphosphatase NudE  50 
 
 
185 aa  176  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00596251  normal  0.391787 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0183  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.59 
 
 
183 aa  176  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.56 
 
 
183 aa  174  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.56 
 
 
183 aa  174  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00239764  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0164  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.56 
 
 
183 aa  174  9e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4188  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.1 
 
 
183 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0167  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.38 
 
 
193 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4718  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.09 
 
 
181 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0156  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.56 
 
 
184 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00016487  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0171  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.38 
 
 
183 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4068  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.62 
 
 
185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4612  ADP-ribose diphosphatase NudE  50 
 
 
184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0117  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.28 
 
 
195 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0129  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.28 
 
 
181 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2294  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.4 
 
 
204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3549  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.55 
 
 
183 aa  172  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0252  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.88 
 
 
190 aa  171  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3623  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.17 
 
 
182 aa  170  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2059  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.81 
 
 
196 aa  171  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3810  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.63 
 
 
186 aa  169  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0224  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.45 
 
 
184 aa  168  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0424  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.3 
 
 
183 aa  167  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2420  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.6 
 
 
184 aa  167  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03249  ADP-ribose diphosphatase  48.09 
 
 
186 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0316  NUDIX hydrolase  48.09 
 
 
186 aa  166  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3868  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.09 
 
 
186 aa  166  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0190  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.67 
 
 
183 aa  166  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3774  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.09 
 
 
186 aa  166  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0316  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.09 
 
 
186 aa  166  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.155326 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4346  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.96 
 
 
181 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03201  hypothetical protein  48.09 
 
 
186 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3592  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.09 
 
 
186 aa  166  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4702  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.09 
 
 
186 aa  166  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.631094  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3674  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.09 
 
 
186 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.251567  normal  0.322169 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3691  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.54 
 
 
198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3800  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.54 
 
 
198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3863  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.54 
 
 
198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3766  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.54 
 
 
198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3693  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.54 
 
 
187 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1467  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.25 
 
 
187 aa  164  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.858308  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00613  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.9 
 
 
188 aa  162  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2302  ADP-ribose diphosphatase NudE  44.15 
 
 
186 aa  161  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2418  NUDIX hydrolase  49.17 
 
 
181 aa  161  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0180  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.86 
 
 
181 aa  161  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001880  ADP compounds hydrolase NudE  47.46 
 
 
189 aa  161  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3734  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.86 
 
 
181 aa  161  7e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3973  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.86 
 
 
181 aa  161  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2913  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.77 
 
 
183 aa  160  9e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2275  ADP-ribose diphosphatase NudE  43.62 
 
 
186 aa  160  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0524  ADP-ribose diphosphatase NudE  44.32 
 
 
192 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0014  ADP-ribose diphosphatase NudE  44.44 
 
 
181 aa  150  1e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3080  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.81 
 
 
187 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01648  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.38 
 
 
182 aa  149  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.541498  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0141  ADP-ribose diphosphatase NudE  42.47 
 
 
182 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0160  ADP-ribose diphosphatase NudE  42.47 
 
 
182 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1756  ADP-ribose diphosphatase NudE  42.31 
 
 
183 aa  134  7.000000000000001e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 
178 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 
178 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  39.64 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  26.92 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  22.22 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  26.95 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 
184 aa  67.8  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 
180 aa  67.8  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  25.41 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  26.16 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5000  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  25.86 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5882  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  32.67 
 
 
183 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  24.12 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  24.12 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  22.99 
 
 
175 aa  63.2  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 
182 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  28.15 
 
 
176 aa  63.2  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0341  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
186 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>