More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01648 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01648  ADP-ribose diphosphatase NudE  100 
 
 		 182 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.541498  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3080  ADP-ribose diphosphatase NudE  83.52 
 
 		 187 aa  302  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0160  ADP-ribose diphosphatase NudE  76.54 
 
 		 182 aa  288  2e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0141  ADP-ribose diphosphatase NudE  76.54 
 
 		 182 aa  288  3e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3623  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.7 
 
 		 182 aa  192  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2418  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 		 181 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0119  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.12 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00596251  normal  0.391787 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03971  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.14 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.222226  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2931  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.42 
 
 		 180 aa  177  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2420  ADP-ribose diphosphatase NudE  55.62 
 
 		 184 aa  176  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3890  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.45 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0138  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.3 
 
 		 187 aa  173  9e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4068  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.9 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3863  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.6 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3693  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.6 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0424  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.3 
 
 		 183 aa  173  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3766  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.6 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3691  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.6 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3800  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.6 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001880  ADP compounds hydrolase NudE  53.12 
 
 		 189 aa  171  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2913  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.6 
 
 		 183 aa  169  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2294  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.55 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00613  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.53 
 
 		 188 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03249  ADP-ribose diphosphatase  46.93 
 
 		 186 aa  167  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0316  NUDIX hydrolase  46.93 
 
 		 186 aa  167  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3868  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.93 
 
 		 186 aa  167  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0316  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.93 
 
 		 186 aa  167  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155326 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3774  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.93 
 
 		 186 aa  167  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3592  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.93 
 
 		 186 aa  167  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03201  hypothetical protein  46.93 
 
 		 186 aa  167  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3810  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.31 
 
 		 186 aa  168  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4702  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.93 
 
 		 186 aa  167  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.631094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3674  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.93 
 
 		 186 aa  167  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.251567  normal  0.322169 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2059  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.28 
 
 		 196 aa  167  8e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0252  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.19 
 
 		 190 aa  166  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2302  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.38 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2275  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.38 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4718  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.07 
 
 		 181 aa  162  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0224  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.38 
 
 		 184 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0331  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.41 
 
 		 184 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0156  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.31 
 
 		 184 aa  160  9e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00016487  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0524  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.78 
 
 		 192 aa  160  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0167  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.31 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4188  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.31 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0171  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.62 
 
 		 183 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0370  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.31 
 
 		 199 aa  157  9e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174333 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4346  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.2 
 
 		 181 aa  155  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.69 
 
 		 183 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.69 
 
 		 183 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00239764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0129  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.07 
 
 		 181 aa  155  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0183  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.38 
 
 		 183 aa  155  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5916  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.09 
 
 		 188 aa  154  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4950  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.47 
 
 		 188 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  hitchhiker  0.0000179344 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68380  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.09 
 
 		 188 aa  154  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000374463  normal  0.555558 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0164  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.07 
 
 		 183 aa  154  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1467  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.39 
 
 		 187 aa  154  9e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.858308  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0014  ADP-ribose diphosphatase NudE  41.01 
 
 		 181 aa  154  9e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0260  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.85 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0135852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0275  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.85 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4612  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.33 
 
 		 184 aa  152  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0117  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.5 
 
 		 195 aa  152  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0285  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.23 
 
 		 188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05490  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.85 
 
 		 188 aa  151  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00271926  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0284  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.85 
 
 		 188 aa  151  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304837 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3734  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.25 
 
 		 181 aa  150  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3973  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.25 
 
 		 181 aa  150  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0180  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.25 
 
 		 181 aa  150  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0393  ADP-ribose diphosphatase NudE  50 
 
 		 188 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3549  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.2 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0190  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.55 
 
 		 183 aa  148  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1756  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.3 
 
 		 183 aa  142  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2661  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.38 
 
 		 211 aa  141  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283798  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4941  ADP-ribose diphosphatase NudE  50 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5402  mutT/nudix family protein  49.38 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 180 aa  80.9  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 		 187 aa  74.3  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 177 aa  72  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  26.62 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  26.85 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  28.57 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  30.6 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  31.14 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  30.13 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 		 199 aa  67  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  25.47 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  25.45 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  25.55 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3899  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>