More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0169 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  100 
 
 		 183 aa  374  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0164  ADP-ribose diphosphatase NudE  99.45 
 
 		 183 aa  373  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  100 
 
 		 183 aa  374  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00239764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4188  ADP-ribose diphosphatase NudE  93.44 
 
 		 183 aa  352  2e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0171  ADP-ribose diphosphatase NudE  92.9 
 
 		 183 aa  349  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0167  ADP-ribose diphosphatase NudE  92.35 
 
 		 193 aa  347  5e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3549  ADP-ribose diphosphatase NudE  89.62 
 
 		 183 aa  344  5e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0190  ADP-ribose diphosphatase NudE  93.99 
 
 		 183 aa  336  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0117  ADP-ribose diphosphatase NudE  84.53 
 
 		 195 aa  325  3e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0224  ADP-ribose diphosphatase NudE  83.06 
 
 		 184 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0183  ADP-ribose diphosphatase NudE  82.51 
 
 		 183 aa  308  4e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0156  ADP-ribose diphosphatase NudE  79.89 
 
 		 184 aa  300  7.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00016487  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0129  ADP-ribose diphosphatase NudE  80.79 
 
 		 181 aa  292  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4718  ADP-ribose diphosphatase NudE  74.86 
 
 		 181 aa  274  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4346  ADP-ribose diphosphatase NudE  75.56 
 
 		 181 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2294  ADP-ribose diphosphatase NudE  65.14 
 
 		 204 aa  231  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2913  ADP-ribose diphosphatase NudE  65.71 
 
 		 183 aa  231  5e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3863  ADP-ribose diphosphatase NudE  61.33 
 
 		 198 aa  228  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3800  ADP-ribose diphosphatase NudE  61.33 
 
 		 198 aa  228  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3766  ADP-ribose diphosphatase NudE  61.33 
 
 		 198 aa  228  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3691  ADP-ribose diphosphatase NudE  61.33 
 
 		 198 aa  228  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3693  ADP-ribose diphosphatase NudE  61.33 
 
 		 187 aa  226  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4702  ADP-ribose diphosphatase NudE  60.77 
 
 		 186 aa  226  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.631094  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03249  ADP-ribose diphosphatase  60.77 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0316  NUDIX hydrolase  60.77 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03201  hypothetical protein  60.77 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3810  ADP-ribose diphosphatase NudE  61.33 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3868  ADP-ribose diphosphatase NudE  60.77 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3774  ADP-ribose diphosphatase NudE  60.77 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0316  ADP-ribose diphosphatase NudE  60.77 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155326 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3674  ADP-ribose diphosphatase NudE  60.77 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.251567  normal  0.322169 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3592  ADP-ribose diphosphatase NudE  60.77 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00613  ADP-ribose diphosphatase NudE  60.44 
 
 		 188 aa  223  9e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001880  ADP compounds hydrolase NudE  60.77 
 
 		 189 aa  222  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4612  ADP-ribose diphosphatase NudE  59.12 
 
 		 184 aa  223  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2059  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.56 
 
 		 196 aa  220  7e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0252  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.89 
 
 		 190 aa  216  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0138  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.29 
 
 		 187 aa  216  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3734  ADP-ribose diphosphatase NudE  59.09 
 
 		 181 aa  214  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0180  ADP-ribose diphosphatase NudE  59.09 
 
 		 181 aa  214  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3973  ADP-ribose diphosphatase NudE  59.09 
 
 		 181 aa  214  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3890  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.56 
 
 		 185 aa  213  9e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2931  ADP-ribose diphosphatase NudE  56.25 
 
 		 180 aa  213  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03971  ADP-ribose diphosphatase NudE  59.3 
 
 		 187 aa  213  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.222226  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4068  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.56 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0331  ADP-ribose diphosphatase NudE  57.22 
 
 		 184 aa  211  7e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0370  ADP-ribose diphosphatase NudE  57.63 
 
 		 199 aa  210  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174333 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0424  ADP-ribose diphosphatase NudE  55.25 
 
 		 183 aa  207  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0119  ADP-ribose diphosphatase NudE  56.9 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00596251  normal  0.391787 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3623  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.57 
 
 		 182 aa  194  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2275  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.11 
 
 		 186 aa  194  7e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2302  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.11 
 
 		 186 aa  194  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2420  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.54 
 
 		 184 aa  194  8.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0014  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.72 
 
 		 181 aa  191  4e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0284  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.63 
 
 		 188 aa  189  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304837 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1467  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.57 
 
 		 187 aa  189  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.858308  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0260  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.63 
 
 		 188 aa  187  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0135852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0275  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.63 
 
 		 188 aa  187  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5916  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.96 
 
 		 188 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68380  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.96 
 
 		 188 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000374463  normal  0.555558 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4950  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.63 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  hitchhiker  0.0000179344 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0393  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.81 
 
 		 188 aa  185  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0285  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.07 
 
 		 188 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05490  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.96 
 
 		 188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00271926  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4941  ADP-ribose diphosphatase NudE  54.75 
 
 		 188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5402  mutT/nudix family protein  54.19 
 
 		 188 aa  177  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2418  NUDIX hydrolase  47.73 
 
 		 181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0524  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.46 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2661  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.56 
 
 		 211 aa  169  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283798  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1756  ADP-ribose diphosphatase NudE  44.13 
 
 		 183 aa  160  7e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3080  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.98 
 
 		 187 aa  160  8.000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01648  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.69 
 
 		 182 aa  155  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.541498  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0141  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.86 
 
 		 182 aa  150  7e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0160  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.29 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 		 183 aa  91.3  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 195 aa  87.8  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 187 aa  85.9  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 183 aa  85.5  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  28.98 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  30.06 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  29.07 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  28.98 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  28.31 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  29.24 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  29.89 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  28.4 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  28.49 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  27.37 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  25.9 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  26.82 
 
 		 186 aa  72  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  29.21 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0185  hypothetical protein  30.46 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.533354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0212  NUDIX hydrolase  30.9 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.465676  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>