More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3623 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3623  ADP-ribose diphosphatase NudE  100 
 
 		 182 aa  370  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2931  ADP-ribose diphosphatase NudE  54.86 
 
 		 180 aa  204  6e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2420  ADP-ribose diphosphatase NudE  55.62 
 
 		 184 aa  202  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03971  ADP-ribose diphosphatase NudE  54.8 
 
 		 187 aa  202  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.222226  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0119  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.96 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00596251  normal  0.391787 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3080  ADP-ribose diphosphatase NudE  55.9 
 
 		 187 aa  196  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.57 
 
 		 183 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.57 
 
 		 183 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00239764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4188  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.71 
 
 		 183 aa  194  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0164  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.57 
 
 		 183 aa  193  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0171  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.45 
 
 		 183 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0167  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.45 
 
 		 193 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01648  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.7 
 
 		 182 aa  192  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.541498  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2059  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.45 
 
 		 196 aa  192  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0141  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.57 
 
 		 182 aa  191  6e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0160  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.57 
 
 		 182 aa  191  6e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3549  ADP-ribose diphosphatase NudE  52 
 
 		 183 aa  190  8e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0138  ADP-ribose diphosphatase NudE  50 
 
 		 187 aa  190  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0224  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.15 
 
 		 184 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3800  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.14 
 
 		 198 aa  187  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3863  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.14 
 
 		 198 aa  187  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3691  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.14 
 
 		 198 aa  187  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3766  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.14 
 
 		 198 aa  187  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00613  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.7 
 
 		 188 aa  187  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0252  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.87 
 
 		 190 aa  187  7e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3693  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.14 
 
 		 187 aa  187  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0117  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.86 
 
 		 195 aa  187  8e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4702  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.57 
 
 		 186 aa  187  9e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.631094  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03249  ADP-ribose diphosphatase  52.57 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0316  NUDIX hydrolase  52.57 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3810  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.57 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3774  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.57 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0316  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.57 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155326 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3868  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.57 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03201  hypothetical protein  52.57 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3592  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.57 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3674  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.57 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.251567  normal  0.322169 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4718  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.71 
 
 		 181 aa  185  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0424  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.43 
 
 		 183 aa  185  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0370  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.4 
 
 		 199 aa  185  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174333 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1467  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.59 
 
 		 187 aa  184  6e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.858308  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0183  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.43 
 
 		 183 aa  184  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3890  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.86 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2913  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.27 
 
 		 183 aa  184  8e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2294  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.98 
 
 		 204 aa  183  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4068  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.29 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0190  ADP-ribose diphosphatase NudE  52 
 
 		 183 aa  182  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001880  ADP compounds hydrolase NudE  50.57 
 
 		 189 aa  182  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0129  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.29 
 
 		 181 aa  182  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0156  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.14 
 
 		 184 aa  181  7e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00016487  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0331  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.57 
 
 		 184 aa  180  8.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4612  ADP-ribose diphosphatase NudE  50.29 
 
 		 184 aa  180  8.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2418  NUDIX hydrolase  50.57 
 
 		 181 aa  179  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3973  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.43 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0180  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.43 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3734  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.43 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4346  ADP-ribose diphosphatase NudE  48 
 
 		 181 aa  177  9e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0393  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.27 
 
 		 188 aa  174  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0524  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.43 
 
 		 192 aa  173  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05490  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.14 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00271926  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0260  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.27 
 
 		 188 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0135852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0275  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.27 
 
 		 188 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0285  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.27 
 
 		 188 aa  170  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5916  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.7 
 
 		 188 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68380  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.7 
 
 		 188 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000374463  normal  0.555558 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4950  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.14 
 
 		 188 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  hitchhiker  0.0000179344 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5402  mutT/nudix family protein  54.55 
 
 		 188 aa  167  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2661  ADP-ribose diphosphatase NudE  49.17 
 
 		 211 aa  167  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283798  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4941  ADP-ribose diphosphatase NudE  53.98 
 
 		 188 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0284  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.14 
 
 		 188 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304837 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0014  ADP-ribose diphosphatase NudE  45.71 
 
 		 181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2302  ADP-ribose diphosphatase NudE  43.41 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2275  ADP-ribose diphosphatase NudE  43.41 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1756  ADP-ribose diphosphatase NudE  44.07 
 
 		 183 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  28.25 
 
 		 177 aa  89.4  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  30.06 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  28.4 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  26.4 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 		 194 aa  77.4  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  29.65 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 208 aa  77.4  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  28.14 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  26.74 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  31.74 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  27.17 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 183 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  27.06 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  28.16 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  29.28 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  25.29 
 
 		 182 aa  72  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 		 204 aa  72  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>